Protein–RNA interactions for Protein: O15068

MCF2L, Guanine nucleotide exchange factor DBS, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2LO15068 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCF2LO15068 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCF2LO15068 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCF2LO15068 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCF2LO15068 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCF2LO15068 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCF2LO15068 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCF2LO15068 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCF2LO15068 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCF2LO15068 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCF2LO15068 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCF2LO15068 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCF2LO15068 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCF2LO15068 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCF2LO15068 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCF2LO15068 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCF2LO15068 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCF2LO15068 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCF2LO15068 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCF2LO15068 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCF2LO15068 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCF2LO15068 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCF2LO15068 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCF2LO15068 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCF2LO15068 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCF2LO15068 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCF2LO15068 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCF2LO15068 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCF2LO15068 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCF2LO15068 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCF2LO15068 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCF2LO15068 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCF2LO15068 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCF2LO15068 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCF2LO15068 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCF2LO15068 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCF2LO15068 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCF2LO15068 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCF2LO15068 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCF2LO15068 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCF2LO15068 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCF2LO15068 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCF2LO15068 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCF2LO15068 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCF2LO15068 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCF2LO15068 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCF2LO15068 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCF2LO15068 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCF2LO15068 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MCF2LO15068 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MCF2LO15068 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MCF2LO15068 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCF2LO15068 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCF2LO15068 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCF2LO15068 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCF2LO15068 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCF2LO15068 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCF2LO15068 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCF2LO15068 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCF2LO15068 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCF2LO15068 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCF2LO15068 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCF2LO15068 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCF2LO15068 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCF2LO15068 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCF2LO15068 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCF2LO15068 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCF2LO15068 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCF2LO15068 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCF2LO15068 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCF2LO15068 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCF2LO15068 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCF2LO15068 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCF2LO15068 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCF2LO15068 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCF2LO15068 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCF2LO15068 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCF2LO15068 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCF2LO15068 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCF2LO15068 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCF2LO15068 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCF2LO15068 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCF2LO15068 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCF2LO15068 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCF2LO15068 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCF2LO15068 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCF2LO15068 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCF2LO15068 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCF2LO15068 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCF2LO15068 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCF2LO15068 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCF2LO15068 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCF2LO15068 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCF2LO15068 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCF2LO15068 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCF2LO15068 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCF2LO15068 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCF2LO15068 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCF2LO15068 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCF2LO15068 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms