Protein–RNA interactions for Protein: O14983

ATP2A1, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A1O14983 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP2A1O14983 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP2A1O14983 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP2A1O14983 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP2A1O14983 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP2A1O14983 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP2A1O14983 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP2A1O14983 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP2A1O14983 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP2A1O14983 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
ATP2A1O14983 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
ATP2A1O14983 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP2A1O14983 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP2A1O14983 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP2A1O14983 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP2A1O14983 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP2A1O14983 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP2A1O14983 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP2A1O14983 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP2A1O14983 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP2A1O14983 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP2A1O14983 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP2A1O14983 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP2A1O14983 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP2A1O14983 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP2A1O14983 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP2A1O14983 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP2A1O14983 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP2A1O14983 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP2A1O14983 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP2A1O14983 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP2A1O14983 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP2A1O14983 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP2A1O14983 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP2A1O14983 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP2A1O14983 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP2A1O14983 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP2A1O14983 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP2A1O14983 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP2A1O14983 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP2A1O14983 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP2A1O14983 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP2A1O14983 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP2A1O14983 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP2A1O14983 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP2A1O14983 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP2A1O14983 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP2A1O14983 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP2A1O14983 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP2A1O14983 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP2A1O14983 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP2A1O14983 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP2A1O14983 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP2A1O14983 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP2A1O14983 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP2A1O14983 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP2A1O14983 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP2A1O14983 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP2A1O14983 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP2A1O14983 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP2A1O14983 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP2A1O14983 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP2A1O14983 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP2A1O14983 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP2A1O14983 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP2A1O14983 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP2A1O14983 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP2A1O14983 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP2A1O14983 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP2A1O14983 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP2A1O14983 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP2A1O14983 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP2A1O14983 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP2A1O14983 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP2A1O14983 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP2A1O14983 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP2A1O14983 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ATP2A1O14983 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ATP2A1O14983 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ATP2A1O14983 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ATP2A1O14983 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP2A1O14983 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP2A1O14983 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP2A1O14983 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP2A1O14983 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP2A1O14983 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP2A1O14983 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP2A1O14983 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP2A1O14983 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP2A1O14983 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP2A1O14983 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP2A1O14983 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP2A1O14983 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP2A1O14983 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP2A1O14983 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP2A1O14983 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP2A1O14983 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP2A1O14983 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP2A1O14983 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP2A1O14983 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms