Protein–RNA interactions for Protein: O00295

TULP2, Tubby-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP2O00295 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TULP2O00295 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TULP2O00295 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TULP2O00295 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TULP2O00295 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TULP2O00295 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TULP2O00295 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TULP2O00295 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TULP2O00295 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TULP2O00295 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TULP2O00295 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TULP2O00295 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TULP2O00295 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TULP2O00295 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TULP2O00295 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TULP2O00295 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TULP2O00295 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TULP2O00295 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TULP2O00295 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TULP2O00295 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TULP2O00295 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TULP2O00295 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TULP2O00295 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TULP2O00295 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TULP2O00295 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TULP2O00295 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TULP2O00295 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TULP2O00295 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TULP2O00295 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TULP2O00295 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TULP2O00295 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TULP2O00295 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TULP2O00295 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TULP2O00295 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TULP2O00295 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TULP2O00295 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TULP2O00295 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TULP2O00295 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TULP2O00295 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TULP2O00295 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TULP2O00295 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TULP2O00295 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TULP2O00295 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TULP2O00295 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TULP2O00295 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TULP2O00295 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TULP2O00295 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TULP2O00295 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TULP2O00295 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TULP2O00295 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TULP2O00295 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TULP2O00295 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TULP2O00295 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TULP2O00295 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TULP2O00295 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TULP2O00295 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TULP2O00295 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TULP2O00295 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TULP2O00295 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TULP2O00295 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TULP2O00295 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TULP2O00295 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TULP2O00295 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TULP2O00295 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TULP2O00295 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TULP2O00295 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TULP2O00295 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TULP2O00295 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TULP2O00295 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TULP2O00295 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TULP2O00295 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TULP2O00295 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TULP2O00295 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TULP2O00295 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TULP2O00295 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TULP2O00295 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TULP2O00295 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TULP2O00295 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TULP2O00295 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TULP2O00295 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TULP2O00295 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TULP2O00295 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TULP2O00295 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TULP2O00295 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TULP2O00295 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TULP2O00295 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TULP2O00295 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TULP2O00295 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TULP2O00295 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TULP2O00295 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TULP2O00295 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TULP2O00295 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TULP2O00295 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TULP2O00295 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TULP2O00295 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TULP2O00295 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TULP2O00295 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TULP2O00295 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TULP2O00295 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TULP2O00295 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms