Protein–RNA interactions for Protein: J3QQQ9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QQQ9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
J3QQQ9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
J3QQQ9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
J3QQQ9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
J3QQQ9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
J3QQQ9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
J3QQQ9 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
J3QQQ9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
J3QQQ9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
J3QQQ9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
J3QQQ9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
J3QQQ9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
J3QQQ9 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
J3QQQ9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
J3QQQ9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
J3QQQ9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
J3QQQ9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
J3QQQ9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
J3QQQ9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
J3QQQ9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
J3QQQ9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
J3QQQ9 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
J3QQQ9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
J3QQQ9 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
J3QQQ9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
J3QQQ9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
J3QQQ9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
J3QQQ9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
J3QQQ9 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
J3QQQ9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3QQQ9 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3QQQ9 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3QQQ9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3QQQ9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3QQQ9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3QQQ9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3QQQ9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3QQQ9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3QQQ9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3QQQ9 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3QQQ9 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
J3QQQ9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
J3QQQ9 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
J3QQQ9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
J3QQQ9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
J3QQQ9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
J3QQQ9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
J3QQQ9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
J3QQQ9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
J3QQQ9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
J3QQQ9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
J3QQQ9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
J3QQQ9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
J3QQQ9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
J3QQQ9 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
J3QQQ9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
J3QQQ9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3QQQ9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3QQQ9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3QQQ9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3QQQ9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3QQQ9 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3QQQ9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3QQQ9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
J3QQQ9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3QQQ9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
J3QQQ9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
J3QQQ9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
J3QQQ9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
J3QQQ9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
J3QQQ9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
J3QQQ9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
J3QQQ9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
J3QQQ9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3QQQ9 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3QQQ9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3QQQ9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3QQQ9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3QQQ9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3QQQ9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3QQQ9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3QQQ9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3QQQ9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3QQQ9 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3QQQ9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
J3QQQ9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3QQQ9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3QQQ9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3QQQ9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3QQQ9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
J3QQQ9 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3QQQ9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3QQQ9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3QQQ9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3QQQ9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3QQQ9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3QQQ9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3QQQ9 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3QQQ9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3QQQ9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms