Protein–RNA interactions for Protein: E9PAV3

NACA, Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha, muscle-specific form, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NACAE9PAV3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NACAE9PAV3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NACAE9PAV3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NACAE9PAV3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NACAE9PAV3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NACAE9PAV3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NACAE9PAV3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NACAE9PAV3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NACAE9PAV3 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NACAE9PAV3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NACAE9PAV3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NACAE9PAV3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NACAE9PAV3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NACAE9PAV3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NACAE9PAV3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NACAE9PAV3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NACAE9PAV3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NACAE9PAV3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NACAE9PAV3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NACAE9PAV3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NACAE9PAV3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NACAE9PAV3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NACAE9PAV3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NACAE9PAV3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NACAE9PAV3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NACAE9PAV3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NACAE9PAV3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NACAE9PAV3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NACAE9PAV3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NACAE9PAV3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NACAE9PAV3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NACAE9PAV3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NACAE9PAV3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NACAE9PAV3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NACAE9PAV3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NACAE9PAV3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NACAE9PAV3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NACAE9PAV3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NACAE9PAV3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NACAE9PAV3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NACAE9PAV3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NACAE9PAV3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NACAE9PAV3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms