Protein–RNA interactions for Protein: A6NL46

Putative UPF0607 protein ENSP00000332738, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NL46 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
A6NL46 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
A6NL46 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
A6NL46 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
A6NL46 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
A6NL46 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
A6NL46 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
A6NL46 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
A6NL46 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
A6NL46 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
A6NL46 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
A6NL46 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
A6NL46 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
A6NL46 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
A6NL46 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
A6NL46 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
A6NL46 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
A6NL46 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
A6NL46 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
A6NL46 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
A6NL46 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
A6NL46 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
A6NL46 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
A6NL46 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
A6NL46 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
A6NL46 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
A6NL46 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
A6NL46 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
A6NL46 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
A6NL46 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
A6NL46 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
A6NL46 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
A6NL46 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
A6NL46 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
A6NL46 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
A6NL46 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
A6NL46 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
A6NL46 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
A6NL46 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
A6NL46 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
A6NL46 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
A6NL46 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
A6NL46 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
A6NL46 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
A6NL46 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
A6NL46 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
A6NL46 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
A6NL46 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
A6NL46 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
A6NL46 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
A6NL46 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
A6NL46 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
A6NL46 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
A6NL46 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
A6NL46 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
A6NL46 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
A6NL46 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
A6NL46 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
A6NL46 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
A6NL46 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
A6NL46 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
A6NL46 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
A6NL46 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
A6NL46 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
A6NL46 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
A6NL46 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
A6NL46 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
A6NL46 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
A6NL46 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
A6NL46 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
A6NL46 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
A6NL46 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
A6NL46 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
A6NL46 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
A6NL46 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
A6NL46 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
A6NL46 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
A6NL46 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
A6NL46 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
A6NL46 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
A6NL46 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
A6NL46 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
A6NL46 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
A6NL46 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
A6NL46 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
A6NL46 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
A6NL46 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
A6NL46 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
A6NL46 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
A6NL46 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
A6NL46 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
A6NL46 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
A6NL46 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
A6NL46 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
A6NL46 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
A6NL46 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
A6NL46 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
A6NL46 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
A6NL46 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
A6NL46 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms