Protein–RNA interactions for Protein: A6NKB5

PCNX2, Pecanex-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX2A6NKB5 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCNX2A6NKB5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCNX2A6NKB5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCNX2A6NKB5 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCNX2A6NKB5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCNX2A6NKB5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCNX2A6NKB5 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCNX2A6NKB5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCNX2A6NKB5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PCNX2A6NKB5 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCNX2A6NKB5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCNX2A6NKB5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCNX2A6NKB5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCNX2A6NKB5 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PCNX2A6NKB5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCNX2A6NKB5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCNX2A6NKB5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCNX2A6NKB5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PCNX2A6NKB5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCNX2A6NKB5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCNX2A6NKB5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCNX2A6NKB5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCNX2A6NKB5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCNX2A6NKB5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCNX2A6NKB5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCNX2A6NKB5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCNX2A6NKB5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCNX2A6NKB5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCNX2A6NKB5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCNX2A6NKB5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCNX2A6NKB5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCNX2A6NKB5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCNX2A6NKB5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCNX2A6NKB5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCNX2A6NKB5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCNX2A6NKB5 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PCNX2A6NKB5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCNX2A6NKB5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCNX2A6NKB5 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PCNX2A6NKB5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCNX2A6NKB5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PCNX2A6NKB5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCNX2A6NKB5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCNX2A6NKB5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCNX2A6NKB5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCNX2A6NKB5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCNX2A6NKB5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCNX2A6NKB5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCNX2A6NKB5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCNX2A6NKB5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCNX2A6NKB5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCNX2A6NKB5 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PCNX2A6NKB5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCNX2A6NKB5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCNX2A6NKB5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCNX2A6NKB5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCNX2A6NKB5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCNX2A6NKB5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCNX2A6NKB5 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCNX2A6NKB5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCNX2A6NKB5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCNX2A6NKB5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCNX2A6NKB5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCNX2A6NKB5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCNX2A6NKB5 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCNX2A6NKB5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCNX2A6NKB5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCNX2A6NKB5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCNX2A6NKB5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCNX2A6NKB5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCNX2A6NKB5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PCNX2A6NKB5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCNX2A6NKB5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCNX2A6NKB5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCNX2A6NKB5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PCNX2A6NKB5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PCNX2A6NKB5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCNX2A6NKB5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCNX2A6NKB5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCNX2A6NKB5 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCNX2A6NKB5 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCNX2A6NKB5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCNX2A6NKB5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCNX2A6NKB5 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCNX2A6NKB5 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCNX2A6NKB5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCNX2A6NKB5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCNX2A6NKB5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCNX2A6NKB5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCNX2A6NKB5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCNX2A6NKB5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCNX2A6NKB5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCNX2A6NKB5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCNX2A6NKB5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCNX2A6NKB5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCNX2A6NKB5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCNX2A6NKB5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCNX2A6NKB5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCNX2A6NKB5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCNX2A6NKB5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms