Protein–RNA interactions for Protein: A4FU28

CTAGE9, cTAGE family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAGE9A4FU28 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTAGE9A4FU28 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CTAGE9A4FU28 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CTAGE9A4FU28 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTAGE9A4FU28 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTAGE9A4FU28 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTAGE9A4FU28 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTAGE9A4FU28 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTAGE9A4FU28 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTAGE9A4FU28 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CTAGE9A4FU28 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
CTAGE9A4FU28 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CTAGE9A4FU28 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CTAGE9A4FU28 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CTAGE9A4FU28 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTAGE9A4FU28 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTAGE9A4FU28 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTAGE9A4FU28 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTAGE9A4FU28 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTAGE9A4FU28 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTAGE9A4FU28 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTAGE9A4FU28 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTAGE9A4FU28 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CTAGE9A4FU28 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTAGE9A4FU28 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTAGE9A4FU28 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTAGE9A4FU28 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTAGE9A4FU28 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTAGE9A4FU28 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTAGE9A4FU28 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTAGE9A4FU28 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTAGE9A4FU28 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTAGE9A4FU28 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTAGE9A4FU28 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTAGE9A4FU28 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTAGE9A4FU28 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTAGE9A4FU28 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTAGE9A4FU28 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTAGE9A4FU28 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTAGE9A4FU28 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTAGE9A4FU28 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTAGE9A4FU28 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTAGE9A4FU28 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTAGE9A4FU28 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTAGE9A4FU28 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTAGE9A4FU28 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTAGE9A4FU28 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTAGE9A4FU28 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTAGE9A4FU28 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTAGE9A4FU28 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTAGE9A4FU28 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTAGE9A4FU28 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTAGE9A4FU28 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTAGE9A4FU28 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTAGE9A4FU28 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTAGE9A4FU28 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTAGE9A4FU28 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTAGE9A4FU28 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTAGE9A4FU28 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTAGE9A4FU28 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTAGE9A4FU28 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTAGE9A4FU28 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTAGE9A4FU28 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTAGE9A4FU28 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTAGE9A4FU28 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTAGE9A4FU28 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTAGE9A4FU28 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTAGE9A4FU28 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTAGE9A4FU28 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTAGE9A4FU28 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTAGE9A4FU28 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTAGE9A4FU28 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTAGE9A4FU28 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTAGE9A4FU28 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTAGE9A4FU28 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTAGE9A4FU28 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTAGE9A4FU28 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTAGE9A4FU28 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTAGE9A4FU28 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTAGE9A4FU28 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTAGE9A4FU28 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTAGE9A4FU28 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CTAGE9A4FU28 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTAGE9A4FU28 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTAGE9A4FU28 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTAGE9A4FU28 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTAGE9A4FU28 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTAGE9A4FU28 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTAGE9A4FU28 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTAGE9A4FU28 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTAGE9A4FU28 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTAGE9A4FU28 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTAGE9A4FU28 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CTAGE9A4FU28 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTAGE9A4FU28 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTAGE9A4FU28 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTAGE9A4FU28 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTAGE9A4FU28 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTAGE9A4FU28 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTAGE9A4FU28 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms