Protein–RNA interactions for Protein: A4D1N5

Putative uncharacterized protein FLJ40288, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4D1N5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A4D1N5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A4D1N5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A4D1N5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A4D1N5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A4D1N5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
A4D1N5 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A4D1N5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
A4D1N5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
A4D1N5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A4D1N5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
A4D1N5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A4D1N5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A4D1N5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A4D1N5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A4D1N5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A4D1N5 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A4D1N5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A4D1N5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A4D1N5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A4D1N5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A4D1N5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A4D1N5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A4D1N5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A4D1N5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A4D1N5 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A4D1N5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A4D1N5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A4D1N5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A4D1N5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A4D1N5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A4D1N5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A4D1N5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A4D1N5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A4D1N5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A4D1N5 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A4D1N5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A4D1N5 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A4D1N5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A4D1N5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A4D1N5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A4D1N5 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A4D1N5 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A4D1N5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A4D1N5 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A4D1N5 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A4D1N5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A4D1N5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A4D1N5 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A4D1N5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A4D1N5 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A4D1N5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A4D1N5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A4D1N5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A4D1N5 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A4D1N5 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A4D1N5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A4D1N5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A4D1N5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A4D1N5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A4D1N5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A4D1N5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A4D1N5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A4D1N5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A4D1N5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A4D1N5 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A4D1N5 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A4D1N5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A4D1N5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A4D1N5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A4D1N5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A4D1N5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A4D1N5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A4D1N5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A4D1N5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A4D1N5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A4D1N5 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A4D1N5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A4D1N5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A4D1N5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A4D1N5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A4D1N5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A4D1N5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A4D1N5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A4D1N5 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A4D1N5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A4D1N5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A4D1N5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A4D1N5 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A4D1N5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A4D1N5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A4D1N5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A4D1N5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
A4D1N5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A4D1N5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A4D1N5 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A4D1N5 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A4D1N5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
A4D1N5 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
A4D1N5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms