Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YY99

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YY99 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
A0A0J9YY99 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0J9YY99 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0J9YY99 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0J9YY99 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0J9YY99 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0J9YY99 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0J9YY99 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms