Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Mrpl40Q9Z2Q5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Mrpl40Q9Z2Q5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Mrpl40Q9Z2Q5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Mrpl40Q9Z2Q5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Mrpl40Q9Z2Q5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Mrpl40Q9Z2Q5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Mrpl40Q9Z2Q5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Mrpl40Q9Z2Q5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Mrpl40Q9Z2Q5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Mrpl40Q9Z2Q5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Mrpl40Q9Z2Q5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Mrpl40Q9Z2Q5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Mrpl40Q9Z2Q5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Mrpl40Q9Z2Q5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Mrpl40Q9Z2Q5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Mrpl40Q9Z2Q5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Mrpl40Q9Z2Q5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Mrpl40Q9Z2Q5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Mrpl40Q9Z2Q5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Mrpl40Q9Z2Q5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Mrpl40Q9Z2Q5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Mrpl40Q9Z2Q5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Mrpl40Q9Z2Q5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Mrpl40Q9Z2Q5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Mrpl40Q9Z2Q5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Mrpl40Q9Z2Q5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Mrpl40Q9Z2Q5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Mrpl40Q9Z2Q5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Mrpl40Q9Z2Q5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Mrpl40Q9Z2Q5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Mrpl40Q9Z2Q5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Mrpl40Q9Z2Q5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Mrpl40Q9Z2Q5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mrpl40Q9Z2Q5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Mrpl40Q9Z2Q5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Mrpl40Q9Z2Q5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mrpl40Q9Z2Q5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mrpl40Q9Z2Q5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Mrpl40Q9Z2Q5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Mrpl40Q9Z2Q5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Mrpl40Q9Z2Q5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Mrpl40Q9Z2Q5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Mrpl40Q9Z2Q5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mrpl40Q9Z2Q5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mrpl40Q9Z2Q5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mrpl40Q9Z2Q5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mrpl40Q9Z2Q5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Mrpl40Q9Z2Q5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mrpl40Q9Z2Q5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mrpl40Q9Z2Q5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mrpl40Q9Z2Q5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Mrpl40Q9Z2Q5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mrpl40Q9Z2Q5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mrpl40Q9Z2Q5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mrpl40Q9Z2Q5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mrpl40Q9Z2Q5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mrpl40Q9Z2Q5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mrpl40Q9Z2Q5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mrpl40Q9Z2Q5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mrpl40Q9Z2Q5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Mrpl40Q9Z2Q5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mrpl40Q9Z2Q5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Mrpl40Q9Z2Q5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Mrpl40Q9Z2Q5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mrpl40Q9Z2Q5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mrpl40Q9Z2Q5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mrpl40Q9Z2Q5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Mrpl40Q9Z2Q5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mrpl40Q9Z2Q5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mrpl40Q9Z2Q5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mrpl40Q9Z2Q5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mrpl40Q9Z2Q5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mrpl40Q9Z2Q5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mrpl40Q9Z2Q5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Mrpl40Q9Z2Q5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mrpl40Q9Z2Q5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mrpl40Q9Z2Q5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mrpl40Q9Z2Q5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mrpl40Q9Z2Q5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mrpl40Q9Z2Q5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Mrpl40Q9Z2Q5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Mrpl40Q9Z2Q5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Mrpl40Q9Z2Q5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mrpl40Q9Z2Q5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mrpl40Q9Z2Q5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mrpl40Q9Z2Q5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mrpl40Q9Z2Q5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms