Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Crlf3Q9Z2L7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Crlf3Q9Z2L7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Crlf3Q9Z2L7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Crlf3Q9Z2L7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Crlf3Q9Z2L7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Crlf3Q9Z2L7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Crlf3Q9Z2L7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Crlf3Q9Z2L7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Crlf3Q9Z2L7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Crlf3Q9Z2L7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Crlf3Q9Z2L7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Crlf3Q9Z2L7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Crlf3Q9Z2L7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Crlf3Q9Z2L7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Crlf3Q9Z2L7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Crlf3Q9Z2L7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Crlf3Q9Z2L7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Crlf3Q9Z2L7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Crlf3Q9Z2L7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Crlf3Q9Z2L7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Crlf3Q9Z2L7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Crlf3Q9Z2L7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Crlf3Q9Z2L7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Crlf3Q9Z2L7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Crlf3Q9Z2L7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Crlf3Q9Z2L7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Crlf3Q9Z2L7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Crlf3Q9Z2L7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Crlf3Q9Z2L7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Crlf3Q9Z2L7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Crlf3Q9Z2L7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Crlf3Q9Z2L7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Crlf3Q9Z2L7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Crlf3Q9Z2L7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Crlf3Q9Z2L7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Crlf3Q9Z2L7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Crlf3Q9Z2L7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Crlf3Q9Z2L7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Crlf3Q9Z2L7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Crlf3Q9Z2L7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Crlf3Q9Z2L7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Crlf3Q9Z2L7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Crlf3Q9Z2L7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Crlf3Q9Z2L7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Crlf3Q9Z2L7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Crlf3Q9Z2L7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Crlf3Q9Z2L7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Crlf3Q9Z2L7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Crlf3Q9Z2L7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Crlf3Q9Z2L7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Crlf3Q9Z2L7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Crlf3Q9Z2L7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Crlf3Q9Z2L7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Crlf3Q9Z2L7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Crlf3Q9Z2L7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Crlf3Q9Z2L7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Crlf3Q9Z2L7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Crlf3Q9Z2L7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Crlf3Q9Z2L7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Crlf3Q9Z2L7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Crlf3Q9Z2L7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Crlf3Q9Z2L7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Crlf3Q9Z2L7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Crlf3Q9Z2L7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Crlf3Q9Z2L7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Crlf3Q9Z2L7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Crlf3Q9Z2L7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Crlf3Q9Z2L7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Crlf3Q9Z2L7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Crlf3Q9Z2L7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Crlf3Q9Z2L7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Crlf3Q9Z2L7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Crlf3Q9Z2L7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Crlf3Q9Z2L7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Crlf3Q9Z2L7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Crlf3Q9Z2L7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Crlf3Q9Z2L7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Crlf3Q9Z2L7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Crlf3Q9Z2L7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Crlf3Q9Z2L7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Crlf3Q9Z2L7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Crlf3Q9Z2L7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Crlf3Q9Z2L7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Crlf3Q9Z2L7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Crlf3Q9Z2L7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Crlf3Q9Z2L7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Crlf3Q9Z2L7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Crlf3Q9Z2L7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Crlf3Q9Z2L7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Crlf3Q9Z2L7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Crlf3Q9Z2L7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Crlf3Q9Z2L7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Crlf3Q9Z2L7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Crlf3Q9Z2L7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Crlf3Q9Z2L7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Crlf3Q9Z2L7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Crlf3Q9Z2L7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Crlf3Q9Z2L7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Crlf3Q9Z2L7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms