Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C6

Upk1b, Uroplakin-1b, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk1bQ9Z2C6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Upk1bQ9Z2C6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Upk1bQ9Z2C6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Upk1bQ9Z2C6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Upk1bQ9Z2C6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Upk1bQ9Z2C6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Upk1bQ9Z2C6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Upk1bQ9Z2C6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Upk1bQ9Z2C6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Upk1bQ9Z2C6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Upk1bQ9Z2C6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Upk1bQ9Z2C6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Upk1bQ9Z2C6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Upk1bQ9Z2C6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Upk1bQ9Z2C6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Upk1bQ9Z2C6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Upk1bQ9Z2C6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Upk1bQ9Z2C6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Upk1bQ9Z2C6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Upk1bQ9Z2C6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Upk1bQ9Z2C6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Upk1bQ9Z2C6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Upk1bQ9Z2C6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Upk1bQ9Z2C6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Upk1bQ9Z2C6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Upk1bQ9Z2C6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Upk1bQ9Z2C6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Upk1bQ9Z2C6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Upk1bQ9Z2C6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Upk1bQ9Z2C6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Upk1bQ9Z2C6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Upk1bQ9Z2C6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Upk1bQ9Z2C6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Upk1bQ9Z2C6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Upk1bQ9Z2C6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Upk1bQ9Z2C6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Upk1bQ9Z2C6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Upk1bQ9Z2C6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Upk1bQ9Z2C6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Upk1bQ9Z2C6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Upk1bQ9Z2C6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Upk1bQ9Z2C6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Upk1bQ9Z2C6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Upk1bQ9Z2C6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Upk1bQ9Z2C6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Upk1bQ9Z2C6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Upk1bQ9Z2C6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Upk1bQ9Z2C6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Upk1bQ9Z2C6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Upk1bQ9Z2C6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Upk1bQ9Z2C6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Upk1bQ9Z2C6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Upk1bQ9Z2C6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Upk1bQ9Z2C6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Upk1bQ9Z2C6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Upk1bQ9Z2C6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Upk1bQ9Z2C6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Upk1bQ9Z2C6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Upk1bQ9Z2C6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Upk1bQ9Z2C6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Upk1bQ9Z2C6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Upk1bQ9Z2C6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Upk1bQ9Z2C6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Upk1bQ9Z2C6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Upk1bQ9Z2C6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Upk1bQ9Z2C6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Upk1bQ9Z2C6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Upk1bQ9Z2C6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Upk1bQ9Z2C6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Upk1bQ9Z2C6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Upk1bQ9Z2C6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Upk1bQ9Z2C6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Upk1bQ9Z2C6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Upk1bQ9Z2C6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Upk1bQ9Z2C6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Upk1bQ9Z2C6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Upk1bQ9Z2C6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Upk1bQ9Z2C6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Upk1bQ9Z2C6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Upk1bQ9Z2C6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Upk1bQ9Z2C6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Upk1bQ9Z2C6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Upk1bQ9Z2C6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Upk1bQ9Z2C6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Upk1bQ9Z2C6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Upk1bQ9Z2C6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Upk1bQ9Z2C6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Upk1bQ9Z2C6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Upk1bQ9Z2C6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Upk1bQ9Z2C6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Upk1bQ9Z2C6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Upk1bQ9Z2C6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Upk1bQ9Z2C6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Upk1bQ9Z2C6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Upk1bQ9Z2C6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Upk1bQ9Z2C6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Upk1bQ9Z2C6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Upk1bQ9Z2C6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Upk1bQ9Z2C6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Upk1bQ9Z2C6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms