Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z273

Tulp1, Tubby-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp1Q9Z273 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Tulp1Q9Z273 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Tulp1Q9Z273 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Tulp1Q9Z273 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Tulp1Q9Z273 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Tulp1Q9Z273 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Tulp1Q9Z273 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Tulp1Q9Z273 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Tulp1Q9Z273 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Tulp1Q9Z273 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Tulp1Q9Z273 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Tulp1Q9Z273 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Tulp1Q9Z273 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Tulp1Q9Z273 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Tulp1Q9Z273 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Tulp1Q9Z273 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Tulp1Q9Z273 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Tulp1Q9Z273 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Tulp1Q9Z273 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Tulp1Q9Z273 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Tulp1Q9Z273 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Tulp1Q9Z273 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Tulp1Q9Z273 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Tulp1Q9Z273 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Tulp1Q9Z273 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tulp1Q9Z273 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Tulp1Q9Z273 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Tulp1Q9Z273 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tulp1Q9Z273 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tulp1Q9Z273 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tulp1Q9Z273 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tulp1Q9Z273 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tulp1Q9Z273 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Tulp1Q9Z273 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Tulp1Q9Z273 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Tulp1Q9Z273 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Tulp1Q9Z273 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Tulp1Q9Z273 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Tulp1Q9Z273 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Tulp1Q9Z273 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Tulp1Q9Z273 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Tulp1Q9Z273 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Tulp1Q9Z273 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Tulp1Q9Z273 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Tulp1Q9Z273 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Tulp1Q9Z273 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Tulp1Q9Z273 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Tulp1Q9Z273 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Tulp1Q9Z273 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Tulp1Q9Z273 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tulp1Q9Z273 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Tulp1Q9Z273 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Tulp1Q9Z273 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tulp1Q9Z273 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Tulp1Q9Z273 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Tulp1Q9Z273 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Tulp1Q9Z273 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Tulp1Q9Z273 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Tulp1Q9Z273 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Tulp1Q9Z273 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Tulp1Q9Z273 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tulp1Q9Z273 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tulp1Q9Z273 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tulp1Q9Z273 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tulp1Q9Z273 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tulp1Q9Z273 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Tulp1Q9Z273 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Tulp1Q9Z273 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Tulp1Q9Z273 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Tulp1Q9Z273 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Tulp1Q9Z273 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Tulp1Q9Z273 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tulp1Q9Z273 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tulp1Q9Z273 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tulp1Q9Z273 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Tulp1Q9Z273 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Tulp1Q9Z273 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Tulp1Q9Z273 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Tulp1Q9Z273 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tulp1Q9Z273 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tulp1Q9Z273 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tulp1Q9Z273 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Tulp1Q9Z273 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Tulp1Q9Z273 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Tulp1Q9Z273 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tulp1Q9Z273 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Tulp1Q9Z273 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tulp1Q9Z273 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tulp1Q9Z273 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Tulp1Q9Z273 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Tulp1Q9Z273 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Tulp1Q9Z273 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tulp1Q9Z273 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Tulp1Q9Z273 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Tulp1Q9Z273 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Tulp1Q9Z273 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Tulp1Q9Z273 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Tulp1Q9Z273 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Tulp1Q9Z273 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Tulp1Q9Z273 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms