Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z183

Padi4, Protein-arginine deiminase type-4, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Padi4Q9Z183 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Padi4Q9Z183 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Padi4Q9Z183 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Padi4Q9Z183 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Padi4Q9Z183 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Padi4Q9Z183 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Padi4Q9Z183 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Padi4Q9Z183 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Padi4Q9Z183 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Padi4Q9Z183 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Padi4Q9Z183 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Padi4Q9Z183 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Padi4Q9Z183 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Padi4Q9Z183 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Padi4Q9Z183 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Padi4Q9Z183 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Padi4Q9Z183 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Padi4Q9Z183 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Padi4Q9Z183 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Padi4Q9Z183 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Padi4Q9Z183 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Padi4Q9Z183 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Padi4Q9Z183 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Padi4Q9Z183 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Padi4Q9Z183 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Padi4Q9Z183 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Padi4Q9Z183 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Padi4Q9Z183 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Padi4Q9Z183 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Padi4Q9Z183 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Padi4Q9Z183 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Padi4Q9Z183 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Padi4Q9Z183 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Padi4Q9Z183 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Padi4Q9Z183 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Padi4Q9Z183 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Padi4Q9Z183 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Padi4Q9Z183 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Padi4Q9Z183 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Padi4Q9Z183 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Padi4Q9Z183 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Padi4Q9Z183 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Padi4Q9Z183 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Padi4Q9Z183 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Padi4Q9Z183 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Padi4Q9Z183 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Padi4Q9Z183 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Padi4Q9Z183 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Padi4Q9Z183 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Padi4Q9Z183 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Padi4Q9Z183 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Padi4Q9Z183 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Padi4Q9Z183 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Padi4Q9Z183 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Padi4Q9Z183 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Padi4Q9Z183 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Padi4Q9Z183 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Padi4Q9Z183 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Padi4Q9Z183 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Padi4Q9Z183 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Padi4Q9Z183 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Padi4Q9Z183 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Padi4Q9Z183 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Padi4Q9Z183 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Padi4Q9Z183 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Padi4Q9Z183 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Padi4Q9Z183 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Padi4Q9Z183 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Padi4Q9Z183 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Padi4Q9Z183 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Padi4Q9Z183 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Padi4Q9Z183 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Padi4Q9Z183 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Padi4Q9Z183 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Padi4Q9Z183 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Padi4Q9Z183 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Padi4Q9Z183 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Padi4Q9Z183 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Padi4Q9Z183 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Padi4Q9Z183 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Padi4Q9Z183 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Padi4Q9Z183 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Padi4Q9Z183 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Padi4Q9Z183 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Padi4Q9Z183 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Padi4Q9Z183 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Padi4Q9Z183 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Padi4Q9Z183 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Padi4Q9Z183 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Padi4Q9Z183 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Padi4Q9Z183 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Padi4Q9Z183 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Padi4Q9Z183 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Padi4Q9Z183 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Padi4Q9Z183 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Padi4Q9Z183 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Padi4Q9Z183 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Padi4Q9Z183 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Padi4Q9Z183 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Padi4Q9Z183 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms