Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z160

Cog1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog1Q9Z160 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cog1Q9Z160 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cog1Q9Z160 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Cog1Q9Z160 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Cog1Q9Z160 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cog1Q9Z160 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cog1Q9Z160 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cog1Q9Z160 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cog1Q9Z160 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cog1Q9Z160 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Cog1Q9Z160 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cog1Q9Z160 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cog1Q9Z160 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cog1Q9Z160 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cog1Q9Z160 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cog1Q9Z160 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cog1Q9Z160 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cog1Q9Z160 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cog1Q9Z160 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cog1Q9Z160 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cog1Q9Z160 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cog1Q9Z160 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cog1Q9Z160 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cog1Q9Z160 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cog1Q9Z160 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Cog1Q9Z160 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cog1Q9Z160 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cog1Q9Z160 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cog1Q9Z160 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cog1Q9Z160 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cog1Q9Z160 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cog1Q9Z160 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cog1Q9Z160 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cog1Q9Z160 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cog1Q9Z160 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cog1Q9Z160 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cog1Q9Z160 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cog1Q9Z160 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Cog1Q9Z160 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cog1Q9Z160 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cog1Q9Z160 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cog1Q9Z160 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cog1Q9Z160 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cog1Q9Z160 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cog1Q9Z160 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cog1Q9Z160 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cog1Q9Z160 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cog1Q9Z160 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cog1Q9Z160 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cog1Q9Z160 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cog1Q9Z160 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cog1Q9Z160 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cog1Q9Z160 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cog1Q9Z160 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cog1Q9Z160 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cog1Q9Z160 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cog1Q9Z160 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cog1Q9Z160 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cog1Q9Z160 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cog1Q9Z160 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cog1Q9Z160 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cog1Q9Z160 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cog1Q9Z160 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cog1Q9Z160 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cog1Q9Z160 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cog1Q9Z160 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cog1Q9Z160 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cog1Q9Z160 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cog1Q9Z160 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Cog1Q9Z160 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cog1Q9Z160 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Cog1Q9Z160 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cog1Q9Z160 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cog1Q9Z160 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cog1Q9Z160 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cog1Q9Z160 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cog1Q9Z160 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cog1Q9Z160 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Cog1Q9Z160 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cog1Q9Z160 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cog1Q9Z160 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cog1Q9Z160 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cog1Q9Z160 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cog1Q9Z160 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cog1Q9Z160 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cog1Q9Z160 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cog1Q9Z160 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cog1Q9Z160 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Cog1Q9Z160 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cog1Q9Z160 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cog1Q9Z160 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Cog1Q9Z160 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cog1Q9Z160 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cog1Q9Z160 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cog1Q9Z160 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cog1Q9Z160 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cog1Q9Z160 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cog1Q9Z160 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cog1Q9Z160 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cog1Q9Z160 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms