Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Skp2Q9Z0Z3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Skp2Q9Z0Z3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Skp2Q9Z0Z3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Skp2Q9Z0Z3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Skp2Q9Z0Z3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Skp2Q9Z0Z3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Skp2Q9Z0Z3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Skp2Q9Z0Z3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Skp2Q9Z0Z3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Skp2Q9Z0Z3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Skp2Q9Z0Z3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Skp2Q9Z0Z3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Skp2Q9Z0Z3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Skp2Q9Z0Z3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Skp2Q9Z0Z3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Skp2Q9Z0Z3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Skp2Q9Z0Z3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Skp2Q9Z0Z3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Skp2Q9Z0Z3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Skp2Q9Z0Z3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Skp2Q9Z0Z3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Skp2Q9Z0Z3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Skp2Q9Z0Z3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Skp2Q9Z0Z3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Skp2Q9Z0Z3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Skp2Q9Z0Z3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Skp2Q9Z0Z3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Skp2Q9Z0Z3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Skp2Q9Z0Z3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Skp2Q9Z0Z3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Skp2Q9Z0Z3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Skp2Q9Z0Z3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Skp2Q9Z0Z3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Skp2Q9Z0Z3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Skp2Q9Z0Z3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Skp2Q9Z0Z3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Skp2Q9Z0Z3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Skp2Q9Z0Z3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Skp2Q9Z0Z3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Skp2Q9Z0Z3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Skp2Q9Z0Z3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Skp2Q9Z0Z3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Skp2Q9Z0Z3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Skp2Q9Z0Z3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Skp2Q9Z0Z3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Skp2Q9Z0Z3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Skp2Q9Z0Z3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Skp2Q9Z0Z3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Skp2Q9Z0Z3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Skp2Q9Z0Z3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Skp2Q9Z0Z3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Skp2Q9Z0Z3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Skp2Q9Z0Z3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Skp2Q9Z0Z3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Skp2Q9Z0Z3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Skp2Q9Z0Z3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Skp2Q9Z0Z3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Skp2Q9Z0Z3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Skp2Q9Z0Z3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Skp2Q9Z0Z3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Skp2Q9Z0Z3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Skp2Q9Z0Z3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Skp2Q9Z0Z3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Skp2Q9Z0Z3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Skp2Q9Z0Z3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Skp2Q9Z0Z3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Skp2Q9Z0Z3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Skp2Q9Z0Z3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Skp2Q9Z0Z3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Skp2Q9Z0Z3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Skp2Q9Z0Z3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Skp2Q9Z0Z3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Skp2Q9Z0Z3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Skp2Q9Z0Z3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Skp2Q9Z0Z3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Skp2Q9Z0Z3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Skp2Q9Z0Z3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Skp2Q9Z0Z3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Skp2Q9Z0Z3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Skp2Q9Z0Z3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Skp2Q9Z0Z3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Skp2Q9Z0Z3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Skp2Q9Z0Z3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Skp2Q9Z0Z3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Skp2Q9Z0Z3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Skp2Q9Z0Z3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Skp2Q9Z0Z3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Skp2Q9Z0Z3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Skp2Q9Z0Z3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Skp2Q9Z0Z3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Skp2Q9Z0Z3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Skp2Q9Z0Z3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Skp2Q9Z0Z3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Skp2Q9Z0Z3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Skp2Q9Z0Z3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Skp2Q9Z0Z3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Skp2Q9Z0Z3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Skp2Q9Z0Z3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Skp2Q9Z0Z3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms