Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTK8

Spo11, Meiotic recombination protein SPO11, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spo11Q9WTK8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Spo11Q9WTK8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Spo11Q9WTK8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Spo11Q9WTK8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Spo11Q9WTK8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Spo11Q9WTK8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Spo11Q9WTK8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Spo11Q9WTK8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Spo11Q9WTK8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Spo11Q9WTK8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Spo11Q9WTK8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Spo11Q9WTK8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Spo11Q9WTK8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Spo11Q9WTK8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Spo11Q9WTK8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Spo11Q9WTK8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Spo11Q9WTK8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Spo11Q9WTK8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Spo11Q9WTK8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Spo11Q9WTK8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Spo11Q9WTK8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Spo11Q9WTK8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Spo11Q9WTK8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Spo11Q9WTK8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Spo11Q9WTK8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Spo11Q9WTK8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spo11Q9WTK8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Spo11Q9WTK8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Spo11Q9WTK8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Spo11Q9WTK8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Spo11Q9WTK8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Spo11Q9WTK8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Spo11Q9WTK8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Spo11Q9WTK8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Spo11Q9WTK8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Spo11Q9WTK8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Spo11Q9WTK8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Spo11Q9WTK8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Spo11Q9WTK8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Spo11Q9WTK8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Spo11Q9WTK8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Spo11Q9WTK8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Spo11Q9WTK8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Spo11Q9WTK8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Spo11Q9WTK8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Spo11Q9WTK8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Spo11Q9WTK8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Spo11Q9WTK8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Spo11Q9WTK8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Spo11Q9WTK8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Spo11Q9WTK8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Spo11Q9WTK8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Spo11Q9WTK8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Spo11Q9WTK8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Spo11Q9WTK8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Spo11Q9WTK8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Spo11Q9WTK8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Spo11Q9WTK8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Spo11Q9WTK8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Spo11Q9WTK8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Spo11Q9WTK8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Spo11Q9WTK8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Spo11Q9WTK8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Spo11Q9WTK8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Spo11Q9WTK8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Spo11Q9WTK8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Spo11Q9WTK8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Spo11Q9WTK8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Spo11Q9WTK8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Spo11Q9WTK8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Spo11Q9WTK8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Spo11Q9WTK8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Spo11Q9WTK8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Spo11Q9WTK8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Spo11Q9WTK8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Spo11Q9WTK8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Spo11Q9WTK8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Spo11Q9WTK8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Spo11Q9WTK8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Spo11Q9WTK8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Spo11Q9WTK8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Spo11Q9WTK8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Spo11Q9WTK8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Spo11Q9WTK8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Spo11Q9WTK8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Spo11Q9WTK8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Spo11Q9WTK8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Spo11Q9WTK8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Spo11Q9WTK8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Spo11Q9WTK8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Spo11Q9WTK8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Spo11Q9WTK8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Spo11Q9WTK8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Spo11Q9WTK8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Spo11Q9WTK8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Spo11Q9WTK8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Spo11Q9WTK8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Spo11Q9WTK8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Spo11Q9WTK8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Spo11Q9WTK8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms