Protein–RNA interactions for Protein: Q9R118

Htra1, Serine protease HTRA1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra1Q9R118 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Htra1Q9R118 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Htra1Q9R118 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Htra1Q9R118 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Htra1Q9R118 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Htra1Q9R118 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Htra1Q9R118 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Htra1Q9R118 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Htra1Q9R118 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Htra1Q9R118 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Htra1Q9R118 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Htra1Q9R118 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Htra1Q9R118 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Htra1Q9R118 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Htra1Q9R118 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Htra1Q9R118 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Htra1Q9R118 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Htra1Q9R118 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Htra1Q9R118 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Htra1Q9R118 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Htra1Q9R118 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Htra1Q9R118 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Htra1Q9R118 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Htra1Q9R118 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Htra1Q9R118 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Htra1Q9R118 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Htra1Q9R118 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Htra1Q9R118 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Htra1Q9R118 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Htra1Q9R118 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Htra1Q9R118 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Htra1Q9R118 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Htra1Q9R118 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Htra1Q9R118 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Htra1Q9R118 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Htra1Q9R118 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Htra1Q9R118 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Htra1Q9R118 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Htra1Q9R118 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Htra1Q9R118 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Htra1Q9R118 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Htra1Q9R118 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Htra1Q9R118 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Htra1Q9R118 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Htra1Q9R118 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Htra1Q9R118 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Htra1Q9R118 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Htra1Q9R118 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Htra1Q9R118 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Htra1Q9R118 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Htra1Q9R118 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Htra1Q9R118 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Htra1Q9R118 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Htra1Q9R118 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Htra1Q9R118 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Htra1Q9R118 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Htra1Q9R118 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Htra1Q9R118 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Htra1Q9R118 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Htra1Q9R118 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Htra1Q9R118 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Htra1Q9R118 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Htra1Q9R118 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Htra1Q9R118 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Htra1Q9R118 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Htra1Q9R118 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Htra1Q9R118 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Htra1Q9R118 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Htra1Q9R118 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Htra1Q9R118 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Htra1Q9R118 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Htra1Q9R118 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Htra1Q9R118 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Htra1Q9R118 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Htra1Q9R118 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Htra1Q9R118 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Htra1Q9R118 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Htra1Q9R118 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Htra1Q9R118 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Htra1Q9R118 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Htra1Q9R118 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Htra1Q9R118 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Htra1Q9R118 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Htra1Q9R118 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Htra1Q9R118 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Htra1Q9R118 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Htra1Q9R118 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Htra1Q9R118 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Htra1Q9R118 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Htra1Q9R118 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Htra1Q9R118 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Htra1Q9R118 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Htra1Q9R118 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Htra1Q9R118 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Htra1Q9R118 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Htra1Q9R118 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Htra1Q9R118 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Htra1Q9R118 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Htra1Q9R118 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Htra1Q9R118 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms