Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ03

Slc39a1, Zinc transporter ZIP1, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc39a1Q9QZ03 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc39a1Q9QZ03 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc39a1Q9QZ03 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc39a1Q9QZ03 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc39a1Q9QZ03 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc39a1Q9QZ03 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Slc39a1Q9QZ03 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc39a1Q9QZ03 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc39a1Q9QZ03 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc39a1Q9QZ03 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Slc39a1Q9QZ03 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc39a1Q9QZ03 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc39a1Q9QZ03 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc39a1Q9QZ03 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc39a1Q9QZ03 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc39a1Q9QZ03 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc39a1Q9QZ03 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc39a1Q9QZ03 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc39a1Q9QZ03 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc39a1Q9QZ03 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc39a1Q9QZ03 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc39a1Q9QZ03 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc39a1Q9QZ03 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc39a1Q9QZ03 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc39a1Q9QZ03 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc39a1Q9QZ03 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc39a1Q9QZ03 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc39a1Q9QZ03 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc39a1Q9QZ03 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc39a1Q9QZ03 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc39a1Q9QZ03 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc39a1Q9QZ03 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc39a1Q9QZ03 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc39a1Q9QZ03 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc39a1Q9QZ03 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc39a1Q9QZ03 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc39a1Q9QZ03 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc39a1Q9QZ03 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc39a1Q9QZ03 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc39a1Q9QZ03 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc39a1Q9QZ03 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc39a1Q9QZ03 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc39a1Q9QZ03 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc39a1Q9QZ03 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc39a1Q9QZ03 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc39a1Q9QZ03 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc39a1Q9QZ03 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc39a1Q9QZ03 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc39a1Q9QZ03 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc39a1Q9QZ03 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc39a1Q9QZ03 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc39a1Q9QZ03 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc39a1Q9QZ03 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc39a1Q9QZ03 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc39a1Q9QZ03 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc39a1Q9QZ03 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc39a1Q9QZ03 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc39a1Q9QZ03 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc39a1Q9QZ03 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc39a1Q9QZ03 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc39a1Q9QZ03 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc39a1Q9QZ03 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc39a1Q9QZ03 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc39a1Q9QZ03 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc39a1Q9QZ03 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc39a1Q9QZ03 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc39a1Q9QZ03 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc39a1Q9QZ03 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc39a1Q9QZ03 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc39a1Q9QZ03 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc39a1Q9QZ03 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc39a1Q9QZ03 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc39a1Q9QZ03 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc39a1Q9QZ03 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc39a1Q9QZ03 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc39a1Q9QZ03 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc39a1Q9QZ03 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc39a1Q9QZ03 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc39a1Q9QZ03 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc39a1Q9QZ03 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc39a1Q9QZ03 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc39a1Q9QZ03 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc39a1Q9QZ03 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc39a1Q9QZ03 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc39a1Q9QZ03 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc39a1Q9QZ03 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc39a1Q9QZ03 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc39a1Q9QZ03 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc39a1Q9QZ03 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc39a1Q9QZ03 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc39a1Q9QZ03 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc39a1Q9QZ03 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc39a1Q9QZ03 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc39a1Q9QZ03 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc39a1Q9QZ03 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc39a1Q9QZ03 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc39a1Q9QZ03 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc39a1Q9QZ03 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc39a1Q9QZ03 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc39a1Q9QZ03 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms