Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYM8

Cenph, Centromere protein H, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenphQ9QYM8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CenphQ9QYM8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CenphQ9QYM8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CenphQ9QYM8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CenphQ9QYM8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CenphQ9QYM8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CenphQ9QYM8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CenphQ9QYM8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CenphQ9QYM8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CenphQ9QYM8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CenphQ9QYM8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CenphQ9QYM8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CenphQ9QYM8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CenphQ9QYM8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CenphQ9QYM8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CenphQ9QYM8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CenphQ9QYM8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CenphQ9QYM8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CenphQ9QYM8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CenphQ9QYM8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CenphQ9QYM8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CenphQ9QYM8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CenphQ9QYM8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CenphQ9QYM8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CenphQ9QYM8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CenphQ9QYM8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CenphQ9QYM8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CenphQ9QYM8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CenphQ9QYM8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CenphQ9QYM8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CenphQ9QYM8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CenphQ9QYM8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CenphQ9QYM8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CenphQ9QYM8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CenphQ9QYM8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CenphQ9QYM8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CenphQ9QYM8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CenphQ9QYM8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CenphQ9QYM8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CenphQ9QYM8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CenphQ9QYM8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CenphQ9QYM8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CenphQ9QYM8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CenphQ9QYM8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CenphQ9QYM8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CenphQ9QYM8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CenphQ9QYM8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CenphQ9QYM8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CenphQ9QYM8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CenphQ9QYM8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CenphQ9QYM8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CenphQ9QYM8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CenphQ9QYM8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CenphQ9QYM8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CenphQ9QYM8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CenphQ9QYM8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CenphQ9QYM8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CenphQ9QYM8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CenphQ9QYM8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CenphQ9QYM8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CenphQ9QYM8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CenphQ9QYM8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CenphQ9QYM8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CenphQ9QYM8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CenphQ9QYM8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CenphQ9QYM8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CenphQ9QYM8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CenphQ9QYM8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CenphQ9QYM8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CenphQ9QYM8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CenphQ9QYM8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CenphQ9QYM8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CenphQ9QYM8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CenphQ9QYM8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CenphQ9QYM8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CenphQ9QYM8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CenphQ9QYM8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CenphQ9QYM8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CenphQ9QYM8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CenphQ9QYM8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CenphQ9QYM8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CenphQ9QYM8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CenphQ9QYM8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CenphQ9QYM8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CenphQ9QYM8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CenphQ9QYM8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CenphQ9QYM8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CenphQ9QYM8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CenphQ9QYM8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CenphQ9QYM8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CenphQ9QYM8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CenphQ9QYM8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CenphQ9QYM8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CenphQ9QYM8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CenphQ9QYM8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CenphQ9QYM8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CenphQ9QYM8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CenphQ9QYM8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CenphQ9QYM8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CenphQ9QYM8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms