Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT0

Cnpy2, Protein canopy homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy2Q9QXT0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cnpy2Q9QXT0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cnpy2Q9QXT0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cnpy2Q9QXT0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cnpy2Q9QXT0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cnpy2Q9QXT0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cnpy2Q9QXT0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Cnpy2Q9QXT0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Cnpy2Q9QXT0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Cnpy2Q9QXT0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cnpy2Q9QXT0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cnpy2Q9QXT0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cnpy2Q9QXT0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cnpy2Q9QXT0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cnpy2Q9QXT0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cnpy2Q9QXT0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cnpy2Q9QXT0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cnpy2Q9QXT0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Cnpy2Q9QXT0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cnpy2Q9QXT0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cnpy2Q9QXT0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cnpy2Q9QXT0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Cnpy2Q9QXT0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cnpy2Q9QXT0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cnpy2Q9QXT0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cnpy2Q9QXT0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cnpy2Q9QXT0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cnpy2Q9QXT0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cnpy2Q9QXT0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cnpy2Q9QXT0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cnpy2Q9QXT0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cnpy2Q9QXT0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cnpy2Q9QXT0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cnpy2Q9QXT0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cnpy2Q9QXT0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cnpy2Q9QXT0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cnpy2Q9QXT0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cnpy2Q9QXT0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cnpy2Q9QXT0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cnpy2Q9QXT0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cnpy2Q9QXT0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cnpy2Q9QXT0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cnpy2Q9QXT0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cnpy2Q9QXT0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cnpy2Q9QXT0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cnpy2Q9QXT0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cnpy2Q9QXT0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Cnpy2Q9QXT0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cnpy2Q9QXT0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Cnpy2Q9QXT0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cnpy2Q9QXT0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cnpy2Q9QXT0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cnpy2Q9QXT0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cnpy2Q9QXT0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Cnpy2Q9QXT0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cnpy2Q9QXT0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cnpy2Q9QXT0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cnpy2Q9QXT0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cnpy2Q9QXT0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cnpy2Q9QXT0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cnpy2Q9QXT0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cnpy2Q9QXT0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cnpy2Q9QXT0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cnpy2Q9QXT0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cnpy2Q9QXT0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cnpy2Q9QXT0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cnpy2Q9QXT0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cnpy2Q9QXT0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cnpy2Q9QXT0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cnpy2Q9QXT0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cnpy2Q9QXT0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cnpy2Q9QXT0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Cnpy2Q9QXT0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cnpy2Q9QXT0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cnpy2Q9QXT0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Cnpy2Q9QXT0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cnpy2Q9QXT0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Cnpy2Q9QXT0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Cnpy2Q9QXT0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cnpy2Q9QXT0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cnpy2Q9QXT0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Cnpy2Q9QXT0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cnpy2Q9QXT0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cnpy2Q9QXT0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Cnpy2Q9QXT0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Cnpy2Q9QXT0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Cnpy2Q9QXT0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cnpy2Q9QXT0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Cnpy2Q9QXT0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cnpy2Q9QXT0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cnpy2Q9QXT0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cnpy2Q9QXT0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cnpy2Q9QXT0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cnpy2Q9QXT0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Cnpy2Q9QXT0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cnpy2Q9QXT0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cnpy2Q9QXT0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cnpy2Q9QXT0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Cnpy2Q9QXT0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cnpy2Q9QXT0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms