Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX15

Clca3a1, Calcium-activated chloride channel regulator 3A-1, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a1Q9QX15 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clca3a1Q9QX15 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clca3a1Q9QX15 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clca3a1Q9QX15 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Clca3a1Q9QX15 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clca3a1Q9QX15 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clca3a1Q9QX15 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Clca3a1Q9QX15 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clca3a1Q9QX15 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clca3a1Q9QX15 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clca3a1Q9QX15 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Clca3a1Q9QX15 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clca3a1Q9QX15 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clca3a1Q9QX15 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clca3a1Q9QX15 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clca3a1Q9QX15 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clca3a1Q9QX15 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Clca3a1Q9QX15 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Clca3a1Q9QX15 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Clca3a1Q9QX15 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clca3a1Q9QX15 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clca3a1Q9QX15 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Clca3a1Q9QX15 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clca3a1Q9QX15 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clca3a1Q9QX15 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clca3a1Q9QX15 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clca3a1Q9QX15 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clca3a1Q9QX15 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clca3a1Q9QX15 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clca3a1Q9QX15 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clca3a1Q9QX15 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clca3a1Q9QX15 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clca3a1Q9QX15 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clca3a1Q9QX15 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clca3a1Q9QX15 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Clca3a1Q9QX15 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clca3a1Q9QX15 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clca3a1Q9QX15 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clca3a1Q9QX15 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Clca3a1Q9QX15 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clca3a1Q9QX15 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clca3a1Q9QX15 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clca3a1Q9QX15 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clca3a1Q9QX15 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clca3a1Q9QX15 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Clca3a1Q9QX15 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clca3a1Q9QX15 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clca3a1Q9QX15 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clca3a1Q9QX15 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clca3a1Q9QX15 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clca3a1Q9QX15 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clca3a1Q9QX15 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clca3a1Q9QX15 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Clca3a1Q9QX15 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Clca3a1Q9QX15 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Clca3a1Q9QX15 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clca3a1Q9QX15 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clca3a1Q9QX15 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clca3a1Q9QX15 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clca3a1Q9QX15 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clca3a1Q9QX15 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clca3a1Q9QX15 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clca3a1Q9QX15 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clca3a1Q9QX15 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clca3a1Q9QX15 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clca3a1Q9QX15 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clca3a1Q9QX15 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clca3a1Q9QX15 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clca3a1Q9QX15 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clca3a1Q9QX15 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clca3a1Q9QX15 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clca3a1Q9QX15 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clca3a1Q9QX15 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clca3a1Q9QX15 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clca3a1Q9QX15 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clca3a1Q9QX15 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clca3a1Q9QX15 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clca3a1Q9QX15 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clca3a1Q9QX15 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clca3a1Q9QX15 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clca3a1Q9QX15 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clca3a1Q9QX15 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Clca3a1Q9QX15 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Clca3a1Q9QX15 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Clca3a1Q9QX15 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Clca3a1Q9QX15 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clca3a1Q9QX15 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clca3a1Q9QX15 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clca3a1Q9QX15 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clca3a1Q9QX15 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Clca3a1Q9QX15 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clca3a1Q9QX15 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clca3a1Q9QX15 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clca3a1Q9QX15 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clca3a1Q9QX15 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Clca3a1Q9QX15 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clca3a1Q9QX15 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clca3a1Q9QX15 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clca3a1Q9QX15 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clca3a1Q9QX15 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms