Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX11

Cyth1, Cytohesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyth1Q9QX11 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Cyth1Q9QX11 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cyth1Q9QX11 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cyth1Q9QX11 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cyth1Q9QX11 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cyth1Q9QX11 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cyth1Q9QX11 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cyth1Q9QX11 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cyth1Q9QX11 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cyth1Q9QX11 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cyth1Q9QX11 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cyth1Q9QX11 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cyth1Q9QX11 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cyth1Q9QX11 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cyth1Q9QX11 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cyth1Q9QX11 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cyth1Q9QX11 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cyth1Q9QX11 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cyth1Q9QX11 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cyth1Q9QX11 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cyth1Q9QX11 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cyth1Q9QX11 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cyth1Q9QX11 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cyth1Q9QX11 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cyth1Q9QX11 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Cyth1Q9QX11 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cyth1Q9QX11 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cyth1Q9QX11 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cyth1Q9QX11 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cyth1Q9QX11 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cyth1Q9QX11 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cyth1Q9QX11 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cyth1Q9QX11 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cyth1Q9QX11 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cyth1Q9QX11 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Cyth1Q9QX11 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cyth1Q9QX11 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cyth1Q9QX11 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cyth1Q9QX11 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cyth1Q9QX11 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cyth1Q9QX11 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Cyth1Q9QX11 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cyth1Q9QX11 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cyth1Q9QX11 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cyth1Q9QX11 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cyth1Q9QX11 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cyth1Q9QX11 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cyth1Q9QX11 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cyth1Q9QX11 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cyth1Q9QX11 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cyth1Q9QX11 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cyth1Q9QX11 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cyth1Q9QX11 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cyth1Q9QX11 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cyth1Q9QX11 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cyth1Q9QX11 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cyth1Q9QX11 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cyth1Q9QX11 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cyth1Q9QX11 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cyth1Q9QX11 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cyth1Q9QX11 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cyth1Q9QX11 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Cyth1Q9QX11 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cyth1Q9QX11 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cyth1Q9QX11 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cyth1Q9QX11 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Cyth1Q9QX11 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cyth1Q9QX11 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cyth1Q9QX11 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cyth1Q9QX11 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cyth1Q9QX11 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cyth1Q9QX11 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cyth1Q9QX11 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cyth1Q9QX11 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cyth1Q9QX11 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cyth1Q9QX11 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cyth1Q9QX11 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cyth1Q9QX11 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Cyth1Q9QX11 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cyth1Q9QX11 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cyth1Q9QX11 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cyth1Q9QX11 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cyth1Q9QX11 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cyth1Q9QX11 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cyth1Q9QX11 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cyth1Q9QX11 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cyth1Q9QX11 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cyth1Q9QX11 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cyth1Q9QX11 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cyth1Q9QX11 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cyth1Q9QX11 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cyth1Q9QX11 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cyth1Q9QX11 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cyth1Q9QX11 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Cyth1Q9QX11 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cyth1Q9QX11 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cyth1Q9QX11 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cyth1Q9QX11 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cyth1Q9QX11 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cyth1Q9QX11 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms