Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29,88■■■□□ 2,37
PdcQ9QW08 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
PdcQ9QW08 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
PdcQ9QW08 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
PdcQ9QW08 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
PdcQ9QW08 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29,82■■■□□ 2,36
PdcQ9QW08 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
PdcQ9QW08 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
PdcQ9QW08 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
PdcQ9QW08 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,78■■■□□ 2,36
PdcQ9QW08 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
PdcQ9QW08 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29,75■■■□□ 2,35
PdcQ9QW08 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
PdcQ9QW08 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,74■■■□□ 2,35
PdcQ9QW08 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
PdcQ9QW08 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
PdcQ9QW08 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
PdcQ9QW08 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,72■■■□□ 2,35
PdcQ9QW08 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29,72■■■□□ 2,35
PdcQ9QW08 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
PdcQ9QW08 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
PdcQ9QW08 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
PdcQ9QW08 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,34
PdcQ9QW08 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,34
PdcQ9QW08 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,65■■■□□ 2,34
PdcQ9QW08 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
PdcQ9QW08 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29,65■■■□□ 2,34
PdcQ9QW08 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
PdcQ9QW08 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
PdcQ9QW08 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
PdcQ9QW08 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29,64■■■□□ 2,34
PdcQ9QW08 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29,63■■■□□ 2,33
PdcQ9QW08 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,61■■■□□ 2,33
PdcQ9QW08 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
PdcQ9QW08 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
PdcQ9QW08 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29,58■■■□□ 2,33
PdcQ9QW08 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,57■■■□□ 2,32
PdcQ9QW08 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
PdcQ9QW08 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29,56■■■□□ 2,32
PdcQ9QW08 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
PdcQ9QW08 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
PdcQ9QW08 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29,54■■■□□ 2,32
PdcQ9QW08 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
PdcQ9QW08 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
PdcQ9QW08 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29,5■■■□□ 2,31
PdcQ9QW08 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
PdcQ9QW08 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
PdcQ9QW08 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
PdcQ9QW08 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
PdcQ9QW08 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
PdcQ9QW08 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29,46■■■□□ 2,31
PdcQ9QW08 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
PdcQ9QW08 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
PdcQ9QW08 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,43■■■□□ 2,3
PdcQ9QW08 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
PdcQ9QW08 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
PdcQ9QW08 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
PdcQ9QW08 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
PdcQ9QW08 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29,41■■■□□ 2,3
PdcQ9QW08 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29,39■■■□□ 2,3
PdcQ9QW08 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
PdcQ9QW08 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29,37■■■□□ 2,29
PdcQ9QW08 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
PdcQ9QW08 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29,36■■■□□ 2,29
PdcQ9QW08 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
PdcQ9QW08 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
PdcQ9QW08 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29,3■■■□□ 2,28
PdcQ9QW08 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
PdcQ9QW08 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
PdcQ9QW08 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
PdcQ9QW08 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,29■■■□□ 2,28
PdcQ9QW08 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
PdcQ9QW08 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
PdcQ9QW08 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
PdcQ9QW08 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,28
PdcQ9QW08 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
PdcQ9QW08 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29,23■■■□□ 2,27
PdcQ9QW08 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
PdcQ9QW08 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,27
PdcQ9QW08 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29,2■■■□□ 2,27
PdcQ9QW08 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,27
PdcQ9QW08 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
PdcQ9QW08 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29,17■■■□□ 2,26
PdcQ9QW08 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
PdcQ9QW08 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
PdcQ9QW08 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
PdcQ9QW08 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
PdcQ9QW08 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,13■■■□□ 2,25
PdcQ9QW08 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,12■■■□□ 2,25
PdcQ9QW08 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29,1■■■□□ 2,25
PdcQ9QW08 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
PdcQ9QW08 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
PdcQ9QW08 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
PdcQ9QW08 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,05■■■□□ 2,24
PdcQ9QW08 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
PdcQ9QW08 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
PdcQ9QW08 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
PdcQ9QW08 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
PdcQ9QW08 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
PdcQ9QW08 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20,2 ms