Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mrpl39Q9JKF7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mrpl39Q9JKF7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Mrpl39Q9JKF7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mrpl39Q9JKF7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mrpl39Q9JKF7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mrpl39Q9JKF7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mrpl39Q9JKF7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mrpl39Q9JKF7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mrpl39Q9JKF7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mrpl39Q9JKF7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mrpl39Q9JKF7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mrpl39Q9JKF7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mrpl39Q9JKF7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mrpl39Q9JKF7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mrpl39Q9JKF7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mrpl39Q9JKF7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mrpl39Q9JKF7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mrpl39Q9JKF7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mrpl39Q9JKF7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mrpl39Q9JKF7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mrpl39Q9JKF7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mrpl39Q9JKF7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Mrpl39Q9JKF7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mrpl39Q9JKF7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Mrpl39Q9JKF7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mrpl39Q9JKF7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mrpl39Q9JKF7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mrpl39Q9JKF7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mrpl39Q9JKF7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mrpl39Q9JKF7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mrpl39Q9JKF7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mrpl39Q9JKF7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mrpl39Q9JKF7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mrpl39Q9JKF7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mrpl39Q9JKF7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mrpl39Q9JKF7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mrpl39Q9JKF7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mrpl39Q9JKF7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mrpl39Q9JKF7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mrpl39Q9JKF7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mrpl39Q9JKF7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mrpl39Q9JKF7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mrpl39Q9JKF7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mrpl39Q9JKF7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mrpl39Q9JKF7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mrpl39Q9JKF7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mrpl39Q9JKF7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mrpl39Q9JKF7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mrpl39Q9JKF7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mrpl39Q9JKF7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Mrpl39Q9JKF7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Mrpl39Q9JKF7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Mrpl39Q9JKF7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mrpl39Q9JKF7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mrpl39Q9JKF7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Mrpl39Q9JKF7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mrpl39Q9JKF7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mrpl39Q9JKF7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mrpl39Q9JKF7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mrpl39Q9JKF7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mrpl39Q9JKF7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mrpl39Q9JKF7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mrpl39Q9JKF7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mrpl39Q9JKF7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mrpl39Q9JKF7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mrpl39Q9JKF7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mrpl39Q9JKF7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mrpl39Q9JKF7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Mrpl39Q9JKF7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mrpl39Q9JKF7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Mrpl39Q9JKF7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mrpl39Q9JKF7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mrpl39Q9JKF7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mrpl39Q9JKF7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mrpl39Q9JKF7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mrpl39Q9JKF7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mrpl39Q9JKF7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Mrpl39Q9JKF7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Mrpl39Q9JKF7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mrpl39Q9JKF7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mrpl39Q9JKF7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mrpl39Q9JKF7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mrpl39Q9JKF7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mrpl39Q9JKF7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mrpl39Q9JKF7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Mrpl39Q9JKF7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mrpl39Q9JKF7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mrpl39Q9JKF7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mrpl39Q9JKF7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mrpl39Q9JKF7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mrpl39Q9JKF7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mrpl39Q9JKF7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mrpl39Q9JKF7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mrpl39Q9JKF7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mrpl39Q9JKF7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mrpl39Q9JKF7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mrpl39Q9JKF7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mrpl39Q9JKF7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mrpl39Q9JKF7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms