Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK48

Sh3glb1, Endophilin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3glb1Q9JK48 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sh3glb1Q9JK48 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sh3glb1Q9JK48 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sh3glb1Q9JK48 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sh3glb1Q9JK48 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sh3glb1Q9JK48 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sh3glb1Q9JK48 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sh3glb1Q9JK48 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sh3glb1Q9JK48 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sh3glb1Q9JK48 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sh3glb1Q9JK48 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sh3glb1Q9JK48 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sh3glb1Q9JK48 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sh3glb1Q9JK48 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sh3glb1Q9JK48 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sh3glb1Q9JK48 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sh3glb1Q9JK48 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sh3glb1Q9JK48 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sh3glb1Q9JK48 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sh3glb1Q9JK48 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sh3glb1Q9JK48 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sh3glb1Q9JK48 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sh3glb1Q9JK48 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sh3glb1Q9JK48 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sh3glb1Q9JK48 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sh3glb1Q9JK48 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sh3glb1Q9JK48 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Sh3glb1Q9JK48 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sh3glb1Q9JK48 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sh3glb1Q9JK48 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sh3glb1Q9JK48 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sh3glb1Q9JK48 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sh3glb1Q9JK48 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sh3glb1Q9JK48 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Sh3glb1Q9JK48 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sh3glb1Q9JK48 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sh3glb1Q9JK48 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sh3glb1Q9JK48 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Sh3glb1Q9JK48 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sh3glb1Q9JK48 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sh3glb1Q9JK48 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sh3glb1Q9JK48 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Sh3glb1Q9JK48 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sh3glb1Q9JK48 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sh3glb1Q9JK48 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sh3glb1Q9JK48 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sh3glb1Q9JK48 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sh3glb1Q9JK48 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sh3glb1Q9JK48 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sh3glb1Q9JK48 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sh3glb1Q9JK48 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sh3glb1Q9JK48 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sh3glb1Q9JK48 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sh3glb1Q9JK48 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sh3glb1Q9JK48 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sh3glb1Q9JK48 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sh3glb1Q9JK48 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sh3glb1Q9JK48 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sh3glb1Q9JK48 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sh3glb1Q9JK48 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sh3glb1Q9JK48 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sh3glb1Q9JK48 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Sh3glb1Q9JK48 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sh3glb1Q9JK48 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sh3glb1Q9JK48 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sh3glb1Q9JK48 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sh3glb1Q9JK48 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sh3glb1Q9JK48 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sh3glb1Q9JK48 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sh3glb1Q9JK48 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sh3glb1Q9JK48 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sh3glb1Q9JK48 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sh3glb1Q9JK48 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sh3glb1Q9JK48 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sh3glb1Q9JK48 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sh3glb1Q9JK48 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sh3glb1Q9JK48 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sh3glb1Q9JK48 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sh3glb1Q9JK48 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sh3glb1Q9JK48 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sh3glb1Q9JK48 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sh3glb1Q9JK48 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sh3glb1Q9JK48 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sh3glb1Q9JK48 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sh3glb1Q9JK48 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sh3glb1Q9JK48 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sh3glb1Q9JK48 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sh3glb1Q9JK48 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Sh3glb1Q9JK48 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sh3glb1Q9JK48 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sh3glb1Q9JK48 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sh3glb1Q9JK48 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sh3glb1Q9JK48 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sh3glb1Q9JK48 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sh3glb1Q9JK48 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sh3glb1Q9JK48 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sh3glb1Q9JK48 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sh3glb1Q9JK48 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sh3glb1Q9JK48 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sh3glb1Q9JK48 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms