Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Tuba8Q9JJZ2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tuba8Q9JJZ2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tuba8Q9JJZ2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tuba8Q9JJZ2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Tuba8Q9JJZ2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tuba8Q9JJZ2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tuba8Q9JJZ2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tuba8Q9JJZ2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Tuba8Q9JJZ2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tuba8Q9JJZ2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tuba8Q9JJZ2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Tuba8Q9JJZ2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tuba8Q9JJZ2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tuba8Q9JJZ2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tuba8Q9JJZ2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tuba8Q9JJZ2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tuba8Q9JJZ2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tuba8Q9JJZ2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tuba8Q9JJZ2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tuba8Q9JJZ2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tuba8Q9JJZ2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tuba8Q9JJZ2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tuba8Q9JJZ2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tuba8Q9JJZ2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tuba8Q9JJZ2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tuba8Q9JJZ2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Tuba8Q9JJZ2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Tuba8Q9JJZ2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tuba8Q9JJZ2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tuba8Q9JJZ2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tuba8Q9JJZ2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tuba8Q9JJZ2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tuba8Q9JJZ2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Tuba8Q9JJZ2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tuba8Q9JJZ2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tuba8Q9JJZ2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tuba8Q9JJZ2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tuba8Q9JJZ2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tuba8Q9JJZ2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tuba8Q9JJZ2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tuba8Q9JJZ2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tuba8Q9JJZ2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tuba8Q9JJZ2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tuba8Q9JJZ2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tuba8Q9JJZ2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tuba8Q9JJZ2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tuba8Q9JJZ2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Tuba8Q9JJZ2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tuba8Q9JJZ2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tuba8Q9JJZ2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Tuba8Q9JJZ2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tuba8Q9JJZ2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tuba8Q9JJZ2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tuba8Q9JJZ2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tuba8Q9JJZ2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tuba8Q9JJZ2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tuba8Q9JJZ2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tuba8Q9JJZ2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tuba8Q9JJZ2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tuba8Q9JJZ2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tuba8Q9JJZ2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tuba8Q9JJZ2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tuba8Q9JJZ2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tuba8Q9JJZ2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tuba8Q9JJZ2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tuba8Q9JJZ2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tuba8Q9JJZ2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tuba8Q9JJZ2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tuba8Q9JJZ2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tuba8Q9JJZ2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tuba8Q9JJZ2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tuba8Q9JJZ2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tuba8Q9JJZ2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tuba8Q9JJZ2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tuba8Q9JJZ2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tuba8Q9JJZ2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tuba8Q9JJZ2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tuba8Q9JJZ2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tuba8Q9JJZ2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tuba8Q9JJZ2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tuba8Q9JJZ2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Tuba8Q9JJZ2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tuba8Q9JJZ2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tuba8Q9JJZ2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tuba8Q9JJZ2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tuba8Q9JJZ2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tuba8Q9JJZ2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tuba8Q9JJZ2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Tuba8Q9JJZ2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tuba8Q9JJZ2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tuba8Q9JJZ2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tuba8Q9JJZ2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tuba8Q9JJZ2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tuba8Q9JJZ2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tuba8Q9JJZ2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tuba8Q9JJZ2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tuba8Q9JJZ2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tuba8Q9JJZ2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tuba8Q9JJZ2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
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