Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ5

Htr3b, 5-hydroxytryptamine receptor 3B, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr3bQ9JHJ5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Htr3bQ9JHJ5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Htr3bQ9JHJ5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Htr3bQ9JHJ5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Htr3bQ9JHJ5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Htr3bQ9JHJ5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Htr3bQ9JHJ5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Htr3bQ9JHJ5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Htr3bQ9JHJ5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Htr3bQ9JHJ5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Htr3bQ9JHJ5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Htr3bQ9JHJ5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Htr3bQ9JHJ5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Htr3bQ9JHJ5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Htr3bQ9JHJ5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Htr3bQ9JHJ5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Htr3bQ9JHJ5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Htr3bQ9JHJ5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Htr3bQ9JHJ5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Htr3bQ9JHJ5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Htr3bQ9JHJ5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Htr3bQ9JHJ5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Htr3bQ9JHJ5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Htr3bQ9JHJ5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Htr3bQ9JHJ5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Htr3bQ9JHJ5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Htr3bQ9JHJ5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Htr3bQ9JHJ5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Htr3bQ9JHJ5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Htr3bQ9JHJ5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Htr3bQ9JHJ5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Htr3bQ9JHJ5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Htr3bQ9JHJ5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Htr3bQ9JHJ5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Htr3bQ9JHJ5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Htr3bQ9JHJ5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Htr3bQ9JHJ5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Htr3bQ9JHJ5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Htr3bQ9JHJ5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Htr3bQ9JHJ5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Htr3bQ9JHJ5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Htr3bQ9JHJ5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Htr3bQ9JHJ5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Htr3bQ9JHJ5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Htr3bQ9JHJ5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Htr3bQ9JHJ5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Htr3bQ9JHJ5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Htr3bQ9JHJ5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Htr3bQ9JHJ5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Htr3bQ9JHJ5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Htr3bQ9JHJ5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Htr3bQ9JHJ5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Htr3bQ9JHJ5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Htr3bQ9JHJ5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Htr3bQ9JHJ5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Htr3bQ9JHJ5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Htr3bQ9JHJ5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Htr3bQ9JHJ5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Htr3bQ9JHJ5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Htr3bQ9JHJ5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Htr3bQ9JHJ5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Htr3bQ9JHJ5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Htr3bQ9JHJ5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Htr3bQ9JHJ5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Htr3bQ9JHJ5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Htr3bQ9JHJ5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Htr3bQ9JHJ5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Htr3bQ9JHJ5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Htr3bQ9JHJ5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Htr3bQ9JHJ5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Htr3bQ9JHJ5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Htr3bQ9JHJ5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Htr3bQ9JHJ5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Htr3bQ9JHJ5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Htr3bQ9JHJ5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Htr3bQ9JHJ5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Htr3bQ9JHJ5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Htr3bQ9JHJ5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Htr3bQ9JHJ5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Htr3bQ9JHJ5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Htr3bQ9JHJ5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Htr3bQ9JHJ5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Htr3bQ9JHJ5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Htr3bQ9JHJ5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Htr3bQ9JHJ5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Htr3bQ9JHJ5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Htr3bQ9JHJ5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Htr3bQ9JHJ5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Htr3bQ9JHJ5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Htr3bQ9JHJ5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Htr3bQ9JHJ5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Htr3bQ9JHJ5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Htr3bQ9JHJ5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Htr3bQ9JHJ5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Htr3bQ9JHJ5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Htr3bQ9JHJ5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Htr3bQ9JHJ5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Htr3bQ9JHJ5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Htr3bQ9JHJ5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Htr3bQ9JHJ5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.6 ms