Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHH9

Copz2, Coatomer subunit zeta-2, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz2Q9JHH9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Copz2Q9JHH9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Copz2Q9JHH9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Copz2Q9JHH9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Copz2Q9JHH9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Copz2Q9JHH9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Copz2Q9JHH9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Copz2Q9JHH9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Copz2Q9JHH9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Copz2Q9JHH9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Copz2Q9JHH9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Copz2Q9JHH9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Copz2Q9JHH9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Copz2Q9JHH9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Copz2Q9JHH9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Copz2Q9JHH9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Copz2Q9JHH9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Copz2Q9JHH9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Copz2Q9JHH9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Copz2Q9JHH9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Copz2Q9JHH9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Copz2Q9JHH9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Copz2Q9JHH9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Copz2Q9JHH9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Copz2Q9JHH9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Copz2Q9JHH9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Copz2Q9JHH9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Copz2Q9JHH9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Copz2Q9JHH9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Copz2Q9JHH9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Copz2Q9JHH9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Copz2Q9JHH9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Copz2Q9JHH9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Copz2Q9JHH9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Copz2Q9JHH9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Copz2Q9JHH9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Copz2Q9JHH9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Copz2Q9JHH9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Copz2Q9JHH9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Copz2Q9JHH9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Copz2Q9JHH9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Copz2Q9JHH9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Copz2Q9JHH9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Copz2Q9JHH9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Copz2Q9JHH9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Copz2Q9JHH9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Copz2Q9JHH9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Copz2Q9JHH9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Copz2Q9JHH9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Copz2Q9JHH9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Copz2Q9JHH9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Copz2Q9JHH9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Copz2Q9JHH9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Copz2Q9JHH9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Copz2Q9JHH9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Copz2Q9JHH9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Copz2Q9JHH9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Copz2Q9JHH9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Copz2Q9JHH9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Copz2Q9JHH9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Copz2Q9JHH9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Copz2Q9JHH9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Copz2Q9JHH9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Copz2Q9JHH9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Copz2Q9JHH9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Copz2Q9JHH9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Copz2Q9JHH9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Copz2Q9JHH9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Copz2Q9JHH9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Copz2Q9JHH9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Copz2Q9JHH9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Copz2Q9JHH9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Copz2Q9JHH9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Copz2Q9JHH9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Copz2Q9JHH9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Copz2Q9JHH9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Copz2Q9JHH9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Copz2Q9JHH9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Copz2Q9JHH9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Copz2Q9JHH9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Copz2Q9JHH9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Copz2Q9JHH9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Copz2Q9JHH9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Copz2Q9JHH9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Copz2Q9JHH9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Copz2Q9JHH9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Copz2Q9JHH9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Copz2Q9JHH9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Copz2Q9JHH9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Copz2Q9JHH9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Copz2Q9JHH9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Copz2Q9JHH9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Copz2Q9JHH9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Copz2Q9JHH9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Copz2Q9JHH9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Copz2Q9JHH9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Copz2Q9JHH9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Copz2Q9JHH9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Copz2Q9JHH9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Copz2Q9JHH9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms