Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG2

Ropn1, Ropporin-1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1Q9ESG2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ropn1Q9ESG2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ropn1Q9ESG2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ropn1Q9ESG2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ropn1Q9ESG2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ropn1Q9ESG2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ropn1Q9ESG2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ropn1Q9ESG2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Ropn1Q9ESG2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ropn1Q9ESG2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ropn1Q9ESG2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ropn1Q9ESG2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ropn1Q9ESG2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ropn1Q9ESG2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ropn1Q9ESG2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ropn1Q9ESG2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ropn1Q9ESG2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ropn1Q9ESG2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ropn1Q9ESG2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ropn1Q9ESG2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ropn1Q9ESG2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ropn1Q9ESG2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ropn1Q9ESG2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ropn1Q9ESG2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ropn1Q9ESG2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ropn1Q9ESG2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ropn1Q9ESG2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ropn1Q9ESG2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ropn1Q9ESG2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ropn1Q9ESG2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ropn1Q9ESG2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ropn1Q9ESG2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ropn1Q9ESG2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ropn1Q9ESG2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ropn1Q9ESG2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ropn1Q9ESG2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ropn1Q9ESG2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ropn1Q9ESG2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ropn1Q9ESG2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ropn1Q9ESG2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ropn1Q9ESG2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ropn1Q9ESG2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ropn1Q9ESG2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ropn1Q9ESG2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ropn1Q9ESG2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ropn1Q9ESG2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ropn1Q9ESG2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ropn1Q9ESG2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ropn1Q9ESG2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ropn1Q9ESG2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ropn1Q9ESG2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ropn1Q9ESG2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ropn1Q9ESG2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ropn1Q9ESG2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ropn1Q9ESG2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ropn1Q9ESG2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ropn1Q9ESG2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ropn1Q9ESG2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ropn1Q9ESG2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ropn1Q9ESG2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ropn1Q9ESG2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ropn1Q9ESG2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ropn1Q9ESG2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ropn1Q9ESG2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ropn1Q9ESG2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ropn1Q9ESG2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ropn1Q9ESG2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ropn1Q9ESG2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ropn1Q9ESG2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ropn1Q9ESG2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ropn1Q9ESG2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ropn1Q9ESG2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ropn1Q9ESG2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ropn1Q9ESG2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ropn1Q9ESG2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ropn1Q9ESG2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ropn1Q9ESG2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ropn1Q9ESG2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ropn1Q9ESG2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ropn1Q9ESG2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ropn1Q9ESG2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ropn1Q9ESG2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ropn1Q9ESG2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ropn1Q9ESG2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ropn1Q9ESG2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ropn1Q9ESG2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ropn1Q9ESG2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ropn1Q9ESG2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ropn1Q9ESG2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ropn1Q9ESG2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ropn1Q9ESG2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ropn1Q9ESG2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ropn1Q9ESG2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ropn1Q9ESG2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ropn1Q9ESG2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ropn1Q9ESG2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ropn1Q9ESG2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ropn1Q9ESG2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ropn1Q9ESG2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ropn1Q9ESG2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms