Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES30

C1qtnf3, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qtnf3Q9ES30 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
C1qtnf3Q9ES30 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
C1qtnf3Q9ES30 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
C1qtnf3Q9ES30 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25,4■■□□□ 1,66
C1qtnf3Q9ES30 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,65
C1qtnf3Q9ES30 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
C1qtnf3Q9ES30 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25,37■■□□□ 1,65
C1qtnf3Q9ES30 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25,36■■□□□ 1,65
C1qtnf3Q9ES30 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25,35■■□□□ 1,65
C1qtnf3Q9ES30 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25,35■■□□□ 1,65
C1qtnf3Q9ES30 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
C1qtnf3Q9ES30 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25,33■■□□□ 1,65
C1qtnf3Q9ES30 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
C1qtnf3Q9ES30 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,32■■□□□ 1,64
C1qtnf3Q9ES30 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
C1qtnf3Q9ES30 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
C1qtnf3Q9ES30 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
C1qtnf3Q9ES30 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25,3■■□□□ 1,64
C1qtnf3Q9ES30 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
C1qtnf3Q9ES30 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,28■■□□□ 1,64
C1qtnf3Q9ES30 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
C1qtnf3Q9ES30 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
C1qtnf3Q9ES30 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,28■■□□□ 1,64
C1qtnf3Q9ES30 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
C1qtnf3Q9ES30 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
C1qtnf3Q9ES30 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25,24■■□□□ 1,63
C1qtnf3Q9ES30 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,23■■□□□ 1,63
C1qtnf3Q9ES30 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25,23■■□□□ 1,63
C1qtnf3Q9ES30 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
C1qtnf3Q9ES30 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25,21■■□□□ 1,63
C1qtnf3Q9ES30 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
C1qtnf3Q9ES30 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25,19■■□□□ 1,62
C1qtnf3Q9ES30 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
C1qtnf3Q9ES30 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25,18■■□□□ 1,62
C1qtnf3Q9ES30 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,18■■□□□ 1,62
C1qtnf3Q9ES30 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
C1qtnf3Q9ES30 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
C1qtnf3Q9ES30 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
C1qtnf3Q9ES30 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
C1qtnf3Q9ES30 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
C1qtnf3Q9ES30 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
C1qtnf3Q9ES30 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
C1qtnf3Q9ES30 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
C1qtnf3Q9ES30 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
C1qtnf3Q9ES30 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
C1qtnf3Q9ES30 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
C1qtnf3Q9ES30 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
C1qtnf3Q9ES30 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,09■■□□□ 1,61
C1qtnf3Q9ES30 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
C1qtnf3Q9ES30 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
C1qtnf3Q9ES30 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
C1qtnf3Q9ES30 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25,08■■□□□ 1,61
C1qtnf3Q9ES30 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25,05■■□□□ 1,6
C1qtnf3Q9ES30 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
C1qtnf3Q9ES30 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
C1qtnf3Q9ES30 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
C1qtnf3Q9ES30 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
C1qtnf3Q9ES30 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
C1qtnf3Q9ES30 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
C1qtnf3Q9ES30 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,99■■□□□ 1,59
C1qtnf3Q9ES30 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,99■■□□□ 1,59
C1qtnf3Q9ES30 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
C1qtnf3Q9ES30 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24,98■■□□□ 1,59
C1qtnf3Q9ES30 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
C1qtnf3Q9ES30 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,59
C1qtnf3Q9ES30 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
C1qtnf3Q9ES30 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
C1qtnf3Q9ES30 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
C1qtnf3Q9ES30 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24,89■■□□□ 1,58
C1qtnf3Q9ES30 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24,89■■□□□ 1,57
C1qtnf3Q9ES30 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,87■■□□□ 1,57
C1qtnf3Q9ES30 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
C1qtnf3Q9ES30 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
C1qtnf3Q9ES30 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24,87■■□□□ 1,57
C1qtnf3Q9ES30 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
C1qtnf3Q9ES30 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
C1qtnf3Q9ES30 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24,86■■□□□ 1,57
C1qtnf3Q9ES30 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
C1qtnf3Q9ES30 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
C1qtnf3Q9ES30 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
C1qtnf3Q9ES30 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
C1qtnf3Q9ES30 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24,83■■□□□ 1,57
C1qtnf3Q9ES30 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
C1qtnf3Q9ES30 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24,81■■□□□ 1,56
C1qtnf3Q9ES30 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,81■■□□□ 1,56
C1qtnf3Q9ES30 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24,81■■□□□ 1,56
C1qtnf3Q9ES30 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
C1qtnf3Q9ES30 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24,8■■□□□ 1,56
C1qtnf3Q9ES30 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24,79■■□□□ 1,56
C1qtnf3Q9ES30 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
C1qtnf3Q9ES30 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24,77■■□□□ 1,56
C1qtnf3Q9ES30 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
C1qtnf3Q9ES30 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
C1qtnf3Q9ES30 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
C1qtnf3Q9ES30 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24,75■■□□□ 1,55
C1qtnf3Q9ES30 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24,75■■□□□ 1,55
C1qtnf3Q9ES30 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24,74■■□□□ 1,55
C1qtnf3Q9ES30 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
C1qtnf3Q9ES30 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
C1qtnf3Q9ES30 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,71■■□□□ 1,55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,3 ms