Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH7

Hipk3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk3Q9ERH7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hipk3Q9ERH7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hipk3Q9ERH7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hipk3Q9ERH7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hipk3Q9ERH7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Hipk3Q9ERH7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Hipk3Q9ERH7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hipk3Q9ERH7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Hipk3Q9ERH7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hipk3Q9ERH7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hipk3Q9ERH7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hipk3Q9ERH7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hipk3Q9ERH7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Hipk3Q9ERH7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hipk3Q9ERH7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Hipk3Q9ERH7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hipk3Q9ERH7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hipk3Q9ERH7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hipk3Q9ERH7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hipk3Q9ERH7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hipk3Q9ERH7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hipk3Q9ERH7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hipk3Q9ERH7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hipk3Q9ERH7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hipk3Q9ERH7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Hipk3Q9ERH7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hipk3Q9ERH7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hipk3Q9ERH7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hipk3Q9ERH7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hipk3Q9ERH7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hipk3Q9ERH7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hipk3Q9ERH7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hipk3Q9ERH7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hipk3Q9ERH7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hipk3Q9ERH7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hipk3Q9ERH7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hipk3Q9ERH7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Hipk3Q9ERH7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hipk3Q9ERH7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hipk3Q9ERH7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hipk3Q9ERH7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hipk3Q9ERH7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hipk3Q9ERH7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hipk3Q9ERH7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Hipk3Q9ERH7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hipk3Q9ERH7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hipk3Q9ERH7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hipk3Q9ERH7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hipk3Q9ERH7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hipk3Q9ERH7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hipk3Q9ERH7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hipk3Q9ERH7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hipk3Q9ERH7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hipk3Q9ERH7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hipk3Q9ERH7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hipk3Q9ERH7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hipk3Q9ERH7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hipk3Q9ERH7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hipk3Q9ERH7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hipk3Q9ERH7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hipk3Q9ERH7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Hipk3Q9ERH7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Hipk3Q9ERH7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Hipk3Q9ERH7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hipk3Q9ERH7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hipk3Q9ERH7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hipk3Q9ERH7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hipk3Q9ERH7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hipk3Q9ERH7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hipk3Q9ERH7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hipk3Q9ERH7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hipk3Q9ERH7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hipk3Q9ERH7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hipk3Q9ERH7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hipk3Q9ERH7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hipk3Q9ERH7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hipk3Q9ERH7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hipk3Q9ERH7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Hipk3Q9ERH7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hipk3Q9ERH7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hipk3Q9ERH7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hipk3Q9ERH7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Hipk3Q9ERH7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hipk3Q9ERH7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hipk3Q9ERH7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hipk3Q9ERH7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hipk3Q9ERH7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hipk3Q9ERH7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hipk3Q9ERH7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hipk3Q9ERH7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hipk3Q9ERH7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hipk3Q9ERH7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hipk3Q9ERH7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hipk3Q9ERH7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hipk3Q9ERH7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hipk3Q9ERH7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hipk3Q9ERH7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hipk3Q9ERH7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hipk3Q9ERH7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Hipk3Q9ERH7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms