Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ06

Hsd17b11, Estradiol 17-beta-dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hsd17b11Q9EQ06 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hsd17b11Q9EQ06 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hsd17b11Q9EQ06 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hsd17b11Q9EQ06 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hsd17b11Q9EQ06 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hsd17b11Q9EQ06 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hsd17b11Q9EQ06 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hsd17b11Q9EQ06 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hsd17b11Q9EQ06 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hsd17b11Q9EQ06 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hsd17b11Q9EQ06 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hsd17b11Q9EQ06 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hsd17b11Q9EQ06 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hsd17b11Q9EQ06 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hsd17b11Q9EQ06 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hsd17b11Q9EQ06 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hsd17b11Q9EQ06 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hsd17b11Q9EQ06 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hsd17b11Q9EQ06 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hsd17b11Q9EQ06 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Hsd17b11Q9EQ06 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hsd17b11Q9EQ06 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hsd17b11Q9EQ06 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hsd17b11Q9EQ06 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hsd17b11Q9EQ06 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hsd17b11Q9EQ06 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hsd17b11Q9EQ06 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hsd17b11Q9EQ06 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hsd17b11Q9EQ06 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hsd17b11Q9EQ06 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hsd17b11Q9EQ06 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hsd17b11Q9EQ06 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hsd17b11Q9EQ06 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hsd17b11Q9EQ06 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hsd17b11Q9EQ06 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hsd17b11Q9EQ06 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Hsd17b11Q9EQ06 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hsd17b11Q9EQ06 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hsd17b11Q9EQ06 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hsd17b11Q9EQ06 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hsd17b11Q9EQ06 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hsd17b11Q9EQ06 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Hsd17b11Q9EQ06 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hsd17b11Q9EQ06 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hsd17b11Q9EQ06 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hsd17b11Q9EQ06 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hsd17b11Q9EQ06 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hsd17b11Q9EQ06 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Hsd17b11Q9EQ06 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hsd17b11Q9EQ06 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hsd17b11Q9EQ06 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hsd17b11Q9EQ06 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Hsd17b11Q9EQ06 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hsd17b11Q9EQ06 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hsd17b11Q9EQ06 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hsd17b11Q9EQ06 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hsd17b11Q9EQ06 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hsd17b11Q9EQ06 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Hsd17b11Q9EQ06 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hsd17b11Q9EQ06 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hsd17b11Q9EQ06 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hsd17b11Q9EQ06 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hsd17b11Q9EQ06 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hsd17b11Q9EQ06 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hsd17b11Q9EQ06 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Hsd17b11Q9EQ06 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hsd17b11Q9EQ06 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hsd17b11Q9EQ06 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hsd17b11Q9EQ06 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hsd17b11Q9EQ06 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hsd17b11Q9EQ06 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hsd17b11Q9EQ06 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hsd17b11Q9EQ06 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hsd17b11Q9EQ06 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hsd17b11Q9EQ06 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hsd17b11Q9EQ06 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hsd17b11Q9EQ06 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hsd17b11Q9EQ06 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hsd17b11Q9EQ06 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hsd17b11Q9EQ06 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hsd17b11Q9EQ06 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hsd17b11Q9EQ06 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hsd17b11Q9EQ06 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hsd17b11Q9EQ06 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hsd17b11Q9EQ06 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hsd17b11Q9EQ06 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hsd17b11Q9EQ06 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hsd17b11Q9EQ06 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hsd17b11Q9EQ06 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hsd17b11Q9EQ06 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Hsd17b11Q9EQ06 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hsd17b11Q9EQ06 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Hsd17b11Q9EQ06 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hsd17b11Q9EQ06 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hsd17b11Q9EQ06 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hsd17b11Q9EQ06 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hsd17b11Q9EQ06 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hsd17b11Q9EQ06 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hsd17b11Q9EQ06 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Hsd17b11Q9EQ06 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms