Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP82

Wdr4, tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase non-catalytic subunit WDR4, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr4Q9EP82 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Wdr4Q9EP82 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Wdr4Q9EP82 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Wdr4Q9EP82 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Wdr4Q9EP82 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Wdr4Q9EP82 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Wdr4Q9EP82 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Wdr4Q9EP82 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Wdr4Q9EP82 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Wdr4Q9EP82 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Wdr4Q9EP82 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Wdr4Q9EP82 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Wdr4Q9EP82 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Wdr4Q9EP82 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Wdr4Q9EP82 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Wdr4Q9EP82 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Wdr4Q9EP82 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Wdr4Q9EP82 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Wdr4Q9EP82 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Wdr4Q9EP82 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Wdr4Q9EP82 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Wdr4Q9EP82 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Wdr4Q9EP82 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Wdr4Q9EP82 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Wdr4Q9EP82 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Wdr4Q9EP82 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Wdr4Q9EP82 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Wdr4Q9EP82 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Wdr4Q9EP82 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Wdr4Q9EP82 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Wdr4Q9EP82 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Wdr4Q9EP82 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Wdr4Q9EP82 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Wdr4Q9EP82 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Wdr4Q9EP82 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Wdr4Q9EP82 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Wdr4Q9EP82 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Wdr4Q9EP82 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Wdr4Q9EP82 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Wdr4Q9EP82 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Wdr4Q9EP82 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Wdr4Q9EP82 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Wdr4Q9EP82 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Wdr4Q9EP82 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Wdr4Q9EP82 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Wdr4Q9EP82 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Wdr4Q9EP82 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Wdr4Q9EP82 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Wdr4Q9EP82 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Wdr4Q9EP82 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Wdr4Q9EP82 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Wdr4Q9EP82 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Wdr4Q9EP82 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Wdr4Q9EP82 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Wdr4Q9EP82 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Wdr4Q9EP82 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Wdr4Q9EP82 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Wdr4Q9EP82 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Wdr4Q9EP82 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Wdr4Q9EP82 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Wdr4Q9EP82 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Wdr4Q9EP82 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Wdr4Q9EP82 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Wdr4Q9EP82 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Wdr4Q9EP82 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Wdr4Q9EP82 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Wdr4Q9EP82 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Wdr4Q9EP82 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Wdr4Q9EP82 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Wdr4Q9EP82 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Wdr4Q9EP82 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Wdr4Q9EP82 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Wdr4Q9EP82 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Wdr4Q9EP82 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Wdr4Q9EP82 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Wdr4Q9EP82 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Wdr4Q9EP82 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Wdr4Q9EP82 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Wdr4Q9EP82 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Wdr4Q9EP82 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Wdr4Q9EP82 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Wdr4Q9EP82 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Wdr4Q9EP82 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Wdr4Q9EP82 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Wdr4Q9EP82 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Wdr4Q9EP82 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Wdr4Q9EP82 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Wdr4Q9EP82 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Wdr4Q9EP82 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Wdr4Q9EP82 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Wdr4Q9EP82 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Wdr4Q9EP82 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Wdr4Q9EP82 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Wdr4Q9EP82 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Wdr4Q9EP82 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Wdr4Q9EP82 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Wdr4Q9EP82 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Wdr4Q9EP82 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Wdr4Q9EP82 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Wdr4Q9EP82 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.7 ms