Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP64

Tnmd, Tenomodulin, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnmdQ9EP64 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
TnmdQ9EP64 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,76■■■□□ 2,36
TnmdQ9EP64 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
TnmdQ9EP64 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29,75■■■□□ 2,35
TnmdQ9EP64 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
TnmdQ9EP64 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
TnmdQ9EP64 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
TnmdQ9EP64 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
TnmdQ9EP64 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
TnmdQ9EP64 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
TnmdQ9EP64 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29,68■■■□□ 2,34
TnmdQ9EP64 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29,67■■■□□ 2,34
TnmdQ9EP64 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
TnmdQ9EP64 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,63■■■□□ 2,33
TnmdQ9EP64 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29,62■■■□□ 2,33
TnmdQ9EP64 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
TnmdQ9EP64 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,61■■■□□ 2,33
TnmdQ9EP64 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
TnmdQ9EP64 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
TnmdQ9EP64 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
TnmdQ9EP64 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,57■■■□□ 2,32
TnmdQ9EP64 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
TnmdQ9EP64 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
TnmdQ9EP64 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
TnmdQ9EP64 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,54■■■□□ 2,32
TnmdQ9EP64 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
TnmdQ9EP64 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
TnmdQ9EP64 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
TnmdQ9EP64 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
TnmdQ9EP64 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29,5■■■□□ 2,31
TnmdQ9EP64 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
TnmdQ9EP64 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
TnmdQ9EP64 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29,48■■■□□ 2,31
TnmdQ9EP64 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29,47■■■□□ 2,31
TnmdQ9EP64 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
TnmdQ9EP64 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
TnmdQ9EP64 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29,45■■■□□ 2,31
TnmdQ9EP64 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29,45■■■□□ 2,3
TnmdQ9EP64 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29,43■■■□□ 2,3
TnmdQ9EP64 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
TnmdQ9EP64 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29,42■■■□□ 2,3
TnmdQ9EP64 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
TnmdQ9EP64 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
TnmdQ9EP64 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,29
TnmdQ9EP64 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
TnmdQ9EP64 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
TnmdQ9EP64 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
TnmdQ9EP64 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29,37■■■□□ 2,29
TnmdQ9EP64 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
TnmdQ9EP64 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,34■■■□□ 2,29
TnmdQ9EP64 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,34■■■□□ 2,29
TnmdQ9EP64 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29,32■■■□□ 2,28
TnmdQ9EP64 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
TnmdQ9EP64 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,32■■■□□ 2,28
TnmdQ9EP64 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29,32■■■□□ 2,28
TnmdQ9EP64 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
TnmdQ9EP64 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29,31■■■□□ 2,28
TnmdQ9EP64 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
TnmdQ9EP64 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
TnmdQ9EP64 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29,3■■■□□ 2,28
TnmdQ9EP64 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
TnmdQ9EP64 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
TnmdQ9EP64 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
TnmdQ9EP64 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,27■■■□□ 2,28
TnmdQ9EP64 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29,26■■■□□ 2,27
TnmdQ9EP64 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29,26■■■□□ 2,27
TnmdQ9EP64 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
TnmdQ9EP64 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29,19■■■□□ 2,26
TnmdQ9EP64 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
TnmdQ9EP64 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
TnmdQ9EP64 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29,17■■■□□ 2,26
TnmdQ9EP64 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
TnmdQ9EP64 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
TnmdQ9EP64 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29,16■■■□□ 2,26
TnmdQ9EP64 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29,16■■■□□ 2,26
TnmdQ9EP64 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
TnmdQ9EP64 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,12■■■□□ 2,25
TnmdQ9EP64 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
TnmdQ9EP64 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
TnmdQ9EP64 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29,09■■■□□ 2,25
TnmdQ9EP64 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29,09■■■□□ 2,25
TnmdQ9EP64 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
TnmdQ9EP64 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
TnmdQ9EP64 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
TnmdQ9EP64 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
TnmdQ9EP64 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
TnmdQ9EP64 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29,04■■■□□ 2,24
TnmdQ9EP64 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
TnmdQ9EP64 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29,02■■■□□ 2,24
TnmdQ9EP64 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
TnmdQ9EP64 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
TnmdQ9EP64 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
TnmdQ9EP64 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
TnmdQ9EP64 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
TnmdQ9EP64 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
TnmdQ9EP64 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
TnmdQ9EP64 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
TnmdQ9EP64 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
TnmdQ9EP64 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
TnmdQ9EP64 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35,6 ms