Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBA6

Tysnd1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tysnd1Q9DBA6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tysnd1Q9DBA6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tysnd1Q9DBA6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tysnd1Q9DBA6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tysnd1Q9DBA6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tysnd1Q9DBA6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Tysnd1Q9DBA6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tysnd1Q9DBA6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Tysnd1Q9DBA6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Tysnd1Q9DBA6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tysnd1Q9DBA6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tysnd1Q9DBA6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tysnd1Q9DBA6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tysnd1Q9DBA6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tysnd1Q9DBA6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tysnd1Q9DBA6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tysnd1Q9DBA6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tysnd1Q9DBA6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tysnd1Q9DBA6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tysnd1Q9DBA6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tysnd1Q9DBA6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tysnd1Q9DBA6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Tysnd1Q9DBA6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Tysnd1Q9DBA6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tysnd1Q9DBA6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tysnd1Q9DBA6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tysnd1Q9DBA6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tysnd1Q9DBA6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tysnd1Q9DBA6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tysnd1Q9DBA6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Tysnd1Q9DBA6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tysnd1Q9DBA6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tysnd1Q9DBA6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tysnd1Q9DBA6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Tysnd1Q9DBA6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tysnd1Q9DBA6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tysnd1Q9DBA6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tysnd1Q9DBA6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tysnd1Q9DBA6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tysnd1Q9DBA6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tysnd1Q9DBA6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tysnd1Q9DBA6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tysnd1Q9DBA6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tysnd1Q9DBA6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tysnd1Q9DBA6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tysnd1Q9DBA6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tysnd1Q9DBA6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tysnd1Q9DBA6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tysnd1Q9DBA6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tysnd1Q9DBA6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tysnd1Q9DBA6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tysnd1Q9DBA6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tysnd1Q9DBA6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tysnd1Q9DBA6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tysnd1Q9DBA6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tysnd1Q9DBA6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tysnd1Q9DBA6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tysnd1Q9DBA6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tysnd1Q9DBA6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tysnd1Q9DBA6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tysnd1Q9DBA6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tysnd1Q9DBA6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tysnd1Q9DBA6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tysnd1Q9DBA6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tysnd1Q9DBA6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tysnd1Q9DBA6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tysnd1Q9DBA6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tysnd1Q9DBA6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tysnd1Q9DBA6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tysnd1Q9DBA6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tysnd1Q9DBA6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Tysnd1Q9DBA6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tysnd1Q9DBA6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tysnd1Q9DBA6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tysnd1Q9DBA6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tysnd1Q9DBA6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tysnd1Q9DBA6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tysnd1Q9DBA6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tysnd1Q9DBA6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tysnd1Q9DBA6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tysnd1Q9DBA6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tysnd1Q9DBA6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tysnd1Q9DBA6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tysnd1Q9DBA6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tysnd1Q9DBA6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tysnd1Q9DBA6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tysnd1Q9DBA6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tysnd1Q9DBA6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tysnd1Q9DBA6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tysnd1Q9DBA6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tysnd1Q9DBA6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tysnd1Q9DBA6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tysnd1Q9DBA6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tysnd1Q9DBA6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tysnd1Q9DBA6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tysnd1Q9DBA6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tysnd1Q9DBA6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tysnd1Q9DBA6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tysnd1Q9DBA6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tysnd1Q9DBA6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms