Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB07

Ift46, Intraflagellar transport protein 46 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift46Q9DB07 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ift46Q9DB07 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ift46Q9DB07 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ift46Q9DB07 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ift46Q9DB07 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ift46Q9DB07 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ift46Q9DB07 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ift46Q9DB07 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ift46Q9DB07 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ift46Q9DB07 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ift46Q9DB07 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ift46Q9DB07 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ift46Q9DB07 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ift46Q9DB07 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ift46Q9DB07 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ift46Q9DB07 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ift46Q9DB07 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ift46Q9DB07 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ift46Q9DB07 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ift46Q9DB07 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ift46Q9DB07 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ift46Q9DB07 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ift46Q9DB07 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ift46Q9DB07 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ift46Q9DB07 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ift46Q9DB07 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ift46Q9DB07 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ift46Q9DB07 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ift46Q9DB07 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ift46Q9DB07 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ift46Q9DB07 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ift46Q9DB07 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ift46Q9DB07 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ift46Q9DB07 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ift46Q9DB07 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ift46Q9DB07 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ift46Q9DB07 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ift46Q9DB07 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ift46Q9DB07 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ift46Q9DB07 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ift46Q9DB07 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ift46Q9DB07 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ift46Q9DB07 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ift46Q9DB07 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ift46Q9DB07 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ift46Q9DB07 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ift46Q9DB07 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ift46Q9DB07 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ift46Q9DB07 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ift46Q9DB07 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ift46Q9DB07 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ift46Q9DB07 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ift46Q9DB07 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ift46Q9DB07 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ift46Q9DB07 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ift46Q9DB07 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ift46Q9DB07 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ift46Q9DB07 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ift46Q9DB07 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ift46Q9DB07 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ift46Q9DB07 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ift46Q9DB07 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ift46Q9DB07 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ift46Q9DB07 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ift46Q9DB07 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ift46Q9DB07 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ift46Q9DB07 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ift46Q9DB07 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ift46Q9DB07 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ift46Q9DB07 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ift46Q9DB07 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ift46Q9DB07 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ift46Q9DB07 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ift46Q9DB07 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ift46Q9DB07 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ift46Q9DB07 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ift46Q9DB07 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ift46Q9DB07 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ift46Q9DB07 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ift46Q9DB07 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ift46Q9DB07 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ift46Q9DB07 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ift46Q9DB07 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ift46Q9DB07 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ift46Q9DB07 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ift46Q9DB07 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ift46Q9DB07 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ift46Q9DB07 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ift46Q9DB07 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ift46Q9DB07 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ift46Q9DB07 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ift46Q9DB07 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ift46Q9DB07 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ift46Q9DB07 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ift46Q9DB07 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ift46Q9DB07 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ift46Q9DB07 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ift46Q9DB07 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ift46Q9DB07 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ift46Q9DB07 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms