Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAC0

Cmtm2b, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm2bQ9DAC0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cmtm2bQ9DAC0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cmtm2bQ9DAC0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Cmtm2bQ9DAC0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cmtm2bQ9DAC0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cmtm2bQ9DAC0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cmtm2bQ9DAC0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cmtm2bQ9DAC0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cmtm2bQ9DAC0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cmtm2bQ9DAC0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cmtm2bQ9DAC0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cmtm2bQ9DAC0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cmtm2bQ9DAC0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cmtm2bQ9DAC0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cmtm2bQ9DAC0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cmtm2bQ9DAC0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cmtm2bQ9DAC0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cmtm2bQ9DAC0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cmtm2bQ9DAC0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cmtm2bQ9DAC0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cmtm2bQ9DAC0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cmtm2bQ9DAC0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cmtm2bQ9DAC0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cmtm2bQ9DAC0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cmtm2bQ9DAC0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cmtm2bQ9DAC0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cmtm2bQ9DAC0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cmtm2bQ9DAC0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cmtm2bQ9DAC0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cmtm2bQ9DAC0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cmtm2bQ9DAC0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cmtm2bQ9DAC0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cmtm2bQ9DAC0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cmtm2bQ9DAC0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cmtm2bQ9DAC0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cmtm2bQ9DAC0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cmtm2bQ9DAC0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cmtm2bQ9DAC0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cmtm2bQ9DAC0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cmtm2bQ9DAC0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cmtm2bQ9DAC0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cmtm2bQ9DAC0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cmtm2bQ9DAC0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cmtm2bQ9DAC0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cmtm2bQ9DAC0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cmtm2bQ9DAC0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cmtm2bQ9DAC0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cmtm2bQ9DAC0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cmtm2bQ9DAC0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cmtm2bQ9DAC0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cmtm2bQ9DAC0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cmtm2bQ9DAC0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cmtm2bQ9DAC0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Cmtm2bQ9DAC0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cmtm2bQ9DAC0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cmtm2bQ9DAC0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cmtm2bQ9DAC0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cmtm2bQ9DAC0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cmtm2bQ9DAC0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cmtm2bQ9DAC0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cmtm2bQ9DAC0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cmtm2bQ9DAC0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cmtm2bQ9DAC0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cmtm2bQ9DAC0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cmtm2bQ9DAC0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cmtm2bQ9DAC0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cmtm2bQ9DAC0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cmtm2bQ9DAC0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cmtm2bQ9DAC0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cmtm2bQ9DAC0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cmtm2bQ9DAC0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cmtm2bQ9DAC0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cmtm2bQ9DAC0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cmtm2bQ9DAC0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cmtm2bQ9DAC0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cmtm2bQ9DAC0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cmtm2bQ9DAC0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cmtm2bQ9DAC0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cmtm2bQ9DAC0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cmtm2bQ9DAC0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cmtm2bQ9DAC0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cmtm2bQ9DAC0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cmtm2bQ9DAC0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cmtm2bQ9DAC0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cmtm2bQ9DAC0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cmtm2bQ9DAC0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cmtm2bQ9DAC0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cmtm2bQ9DAC0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cmtm2bQ9DAC0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cmtm2bQ9DAC0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cmtm2bQ9DAC0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cmtm2bQ9DAC0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cmtm2bQ9DAC0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cmtm2bQ9DAC0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cmtm2bQ9DAC0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cmtm2bQ9DAC0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cmtm2bQ9DAC0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Cmtm2bQ9DAC0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cmtm2bQ9DAC0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Cmtm2bQ9DAC0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms