Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8W5

Psmd12, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd12Q9D8W5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Psmd12Q9D8W5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Psmd12Q9D8W5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Psmd12Q9D8W5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Psmd12Q9D8W5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Psmd12Q9D8W5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Psmd12Q9D8W5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Psmd12Q9D8W5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Psmd12Q9D8W5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Psmd12Q9D8W5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Psmd12Q9D8W5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Psmd12Q9D8W5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Psmd12Q9D8W5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Psmd12Q9D8W5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Psmd12Q9D8W5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Psmd12Q9D8W5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Psmd12Q9D8W5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Psmd12Q9D8W5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Psmd12Q9D8W5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Psmd12Q9D8W5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Psmd12Q9D8W5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Psmd12Q9D8W5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Psmd12Q9D8W5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Psmd12Q9D8W5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Psmd12Q9D8W5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Psmd12Q9D8W5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Psmd12Q9D8W5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Psmd12Q9D8W5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Psmd12Q9D8W5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Psmd12Q9D8W5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Psmd12Q9D8W5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Psmd12Q9D8W5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Psmd12Q9D8W5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Psmd12Q9D8W5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Psmd12Q9D8W5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Psmd12Q9D8W5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Psmd12Q9D8W5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Psmd12Q9D8W5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Psmd12Q9D8W5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Psmd12Q9D8W5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Psmd12Q9D8W5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Psmd12Q9D8W5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Psmd12Q9D8W5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Psmd12Q9D8W5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Psmd12Q9D8W5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Psmd12Q9D8W5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Psmd12Q9D8W5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Psmd12Q9D8W5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Psmd12Q9D8W5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Psmd12Q9D8W5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Psmd12Q9D8W5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Psmd12Q9D8W5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Psmd12Q9D8W5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Psmd12Q9D8W5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Psmd12Q9D8W5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Psmd12Q9D8W5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Psmd12Q9D8W5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Psmd12Q9D8W5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Psmd12Q9D8W5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Psmd12Q9D8W5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Psmd12Q9D8W5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Psmd12Q9D8W5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Psmd12Q9D8W5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Psmd12Q9D8W5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Psmd12Q9D8W5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Psmd12Q9D8W5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Psmd12Q9D8W5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Psmd12Q9D8W5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Psmd12Q9D8W5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Psmd12Q9D8W5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Psmd12Q9D8W5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Psmd12Q9D8W5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Psmd12Q9D8W5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Psmd12Q9D8W5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Psmd12Q9D8W5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Psmd12Q9D8W5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Psmd12Q9D8W5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Psmd12Q9D8W5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Psmd12Q9D8W5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Psmd12Q9D8W5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Psmd12Q9D8W5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Psmd12Q9D8W5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Psmd12Q9D8W5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Psmd12Q9D8W5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Psmd12Q9D8W5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Psmd12Q9D8W5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Psmd12Q9D8W5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Psmd12Q9D8W5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Psmd12Q9D8W5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Psmd12Q9D8W5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Psmd12Q9D8W5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Psmd12Q9D8W5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Psmd12Q9D8W5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Psmd12Q9D8W5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Psmd12Q9D8W5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Psmd12Q9D8W5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Psmd12Q9D8W5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Psmd12Q9D8W5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Psmd12Q9D8W5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Psmd12Q9D8W5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms