Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B7

Jam3, Junctional adhesion molecule C, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jam3Q9D8B7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Jam3Q9D8B7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Jam3Q9D8B7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Jam3Q9D8B7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Jam3Q9D8B7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Jam3Q9D8B7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Jam3Q9D8B7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Jam3Q9D8B7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Jam3Q9D8B7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Jam3Q9D8B7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Jam3Q9D8B7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Jam3Q9D8B7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Jam3Q9D8B7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Jam3Q9D8B7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Jam3Q9D8B7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Jam3Q9D8B7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Jam3Q9D8B7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Jam3Q9D8B7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Jam3Q9D8B7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Jam3Q9D8B7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Jam3Q9D8B7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Jam3Q9D8B7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Jam3Q9D8B7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Jam3Q9D8B7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Jam3Q9D8B7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Jam3Q9D8B7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Jam3Q9D8B7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Jam3Q9D8B7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Jam3Q9D8B7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Jam3Q9D8B7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Jam3Q9D8B7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Jam3Q9D8B7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Jam3Q9D8B7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Jam3Q9D8B7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Jam3Q9D8B7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Jam3Q9D8B7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Jam3Q9D8B7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Jam3Q9D8B7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Jam3Q9D8B7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Jam3Q9D8B7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Jam3Q9D8B7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Jam3Q9D8B7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Jam3Q9D8B7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Jam3Q9D8B7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Jam3Q9D8B7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Jam3Q9D8B7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Jam3Q9D8B7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Jam3Q9D8B7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Jam3Q9D8B7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Jam3Q9D8B7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Jam3Q9D8B7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Jam3Q9D8B7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Jam3Q9D8B7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Jam3Q9D8B7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Jam3Q9D8B7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Jam3Q9D8B7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Jam3Q9D8B7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Jam3Q9D8B7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Jam3Q9D8B7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Jam3Q9D8B7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Jam3Q9D8B7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Jam3Q9D8B7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Jam3Q9D8B7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Jam3Q9D8B7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Jam3Q9D8B7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Jam3Q9D8B7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Jam3Q9D8B7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Jam3Q9D8B7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Jam3Q9D8B7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Jam3Q9D8B7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Jam3Q9D8B7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Jam3Q9D8B7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Jam3Q9D8B7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Jam3Q9D8B7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Jam3Q9D8B7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Jam3Q9D8B7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Jam3Q9D8B7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Jam3Q9D8B7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Jam3Q9D8B7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Jam3Q9D8B7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Jam3Q9D8B7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Jam3Q9D8B7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Jam3Q9D8B7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Jam3Q9D8B7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Jam3Q9D8B7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Jam3Q9D8B7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Jam3Q9D8B7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Jam3Q9D8B7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Jam3Q9D8B7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Jam3Q9D8B7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Jam3Q9D8B7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Jam3Q9D8B7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Jam3Q9D8B7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Jam3Q9D8B7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Jam3Q9D8B7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Jam3Q9D8B7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Jam3Q9D8B7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Jam3Q9D8B7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Jam3Q9D8B7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Jam3Q9D8B7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms