Protein–RNA interactions for Protein: Q9D662

Sec23b, Protein transport protein Sec23B, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23bQ9D662 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sec23bQ9D662 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sec23bQ9D662 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sec23bQ9D662 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sec23bQ9D662 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sec23bQ9D662 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sec23bQ9D662 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sec23bQ9D662 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sec23bQ9D662 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sec23bQ9D662 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sec23bQ9D662 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sec23bQ9D662 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sec23bQ9D662 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sec23bQ9D662 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Sec23bQ9D662 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sec23bQ9D662 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Sec23bQ9D662 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sec23bQ9D662 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sec23bQ9D662 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sec23bQ9D662 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sec23bQ9D662 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sec23bQ9D662 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Sec23bQ9D662 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sec23bQ9D662 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sec23bQ9D662 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Sec23bQ9D662 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sec23bQ9D662 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sec23bQ9D662 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sec23bQ9D662 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sec23bQ9D662 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sec23bQ9D662 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sec23bQ9D662 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sec23bQ9D662 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sec23bQ9D662 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sec23bQ9D662 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sec23bQ9D662 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sec23bQ9D662 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Sec23bQ9D662 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sec23bQ9D662 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sec23bQ9D662 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sec23bQ9D662 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sec23bQ9D662 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sec23bQ9D662 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sec23bQ9D662 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sec23bQ9D662 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sec23bQ9D662 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sec23bQ9D662 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Sec23bQ9D662 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sec23bQ9D662 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sec23bQ9D662 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sec23bQ9D662 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sec23bQ9D662 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sec23bQ9D662 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sec23bQ9D662 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sec23bQ9D662 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Sec23bQ9D662 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sec23bQ9D662 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sec23bQ9D662 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sec23bQ9D662 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sec23bQ9D662 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sec23bQ9D662 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sec23bQ9D662 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Sec23bQ9D662 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sec23bQ9D662 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sec23bQ9D662 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sec23bQ9D662 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sec23bQ9D662 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sec23bQ9D662 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Sec23bQ9D662 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sec23bQ9D662 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Sec23bQ9D662 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sec23bQ9D662 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sec23bQ9D662 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Sec23bQ9D662 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sec23bQ9D662 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sec23bQ9D662 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sec23bQ9D662 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sec23bQ9D662 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sec23bQ9D662 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sec23bQ9D662 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sec23bQ9D662 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sec23bQ9D662 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sec23bQ9D662 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sec23bQ9D662 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sec23bQ9D662 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sec23bQ9D662 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sec23bQ9D662 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Sec23bQ9D662 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sec23bQ9D662 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sec23bQ9D662 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sec23bQ9D662 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sec23bQ9D662 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sec23bQ9D662 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sec23bQ9D662 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sec23bQ9D662 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sec23bQ9D662 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sec23bQ9D662 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sec23bQ9D662 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sec23bQ9D662 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Sec23bQ9D662 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms