Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5J5

Fam122c, Fam122c protein, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam122cQ9D5J5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam122cQ9D5J5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam122cQ9D5J5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam122cQ9D5J5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam122cQ9D5J5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam122cQ9D5J5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fam122cQ9D5J5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fam122cQ9D5J5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam122cQ9D5J5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam122cQ9D5J5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam122cQ9D5J5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam122cQ9D5J5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam122cQ9D5J5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam122cQ9D5J5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam122cQ9D5J5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam122cQ9D5J5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam122cQ9D5J5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam122cQ9D5J5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam122cQ9D5J5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam122cQ9D5J5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam122cQ9D5J5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam122cQ9D5J5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam122cQ9D5J5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam122cQ9D5J5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Fam122cQ9D5J5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam122cQ9D5J5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam122cQ9D5J5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam122cQ9D5J5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam122cQ9D5J5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam122cQ9D5J5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam122cQ9D5J5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam122cQ9D5J5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam122cQ9D5J5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam122cQ9D5J5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam122cQ9D5J5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam122cQ9D5J5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam122cQ9D5J5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam122cQ9D5J5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam122cQ9D5J5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam122cQ9D5J5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam122cQ9D5J5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Fam122cQ9D5J5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fam122cQ9D5J5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fam122cQ9D5J5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam122cQ9D5J5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam122cQ9D5J5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam122cQ9D5J5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam122cQ9D5J5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam122cQ9D5J5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam122cQ9D5J5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam122cQ9D5J5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam122cQ9D5J5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam122cQ9D5J5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam122cQ9D5J5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam122cQ9D5J5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Fam122cQ9D5J5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam122cQ9D5J5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam122cQ9D5J5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam122cQ9D5J5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam122cQ9D5J5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam122cQ9D5J5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam122cQ9D5J5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam122cQ9D5J5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam122cQ9D5J5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam122cQ9D5J5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam122cQ9D5J5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam122cQ9D5J5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam122cQ9D5J5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam122cQ9D5J5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam122cQ9D5J5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam122cQ9D5J5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam122cQ9D5J5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam122cQ9D5J5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam122cQ9D5J5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Fam122cQ9D5J5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam122cQ9D5J5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam122cQ9D5J5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam122cQ9D5J5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam122cQ9D5J5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam122cQ9D5J5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam122cQ9D5J5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam122cQ9D5J5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam122cQ9D5J5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fam122cQ9D5J5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam122cQ9D5J5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam122cQ9D5J5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam122cQ9D5J5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam122cQ9D5J5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam122cQ9D5J5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam122cQ9D5J5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam122cQ9D5J5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fam122cQ9D5J5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam122cQ9D5J5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam122cQ9D5J5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam122cQ9D5J5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam122cQ9D5J5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam122cQ9D5J5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam122cQ9D5J5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam122cQ9D5J5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam122cQ9D5J5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms