Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trappc6bQ9D289 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Trappc6bQ9D289 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trappc6bQ9D289 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trappc6bQ9D289 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trappc6bQ9D289 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trappc6bQ9D289 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trappc6bQ9D289 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trappc6bQ9D289 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trappc6bQ9D289 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trappc6bQ9D289 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trappc6bQ9D289 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trappc6bQ9D289 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Trappc6bQ9D289 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trappc6bQ9D289 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trappc6bQ9D289 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trappc6bQ9D289 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trappc6bQ9D289 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trappc6bQ9D289 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trappc6bQ9D289 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trappc6bQ9D289 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trappc6bQ9D289 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trappc6bQ9D289 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trappc6bQ9D289 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trappc6bQ9D289 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trappc6bQ9D289 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trappc6bQ9D289 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trappc6bQ9D289 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Trappc6bQ9D289 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Trappc6bQ9D289 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Trappc6bQ9D289 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trappc6bQ9D289 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trappc6bQ9D289 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trappc6bQ9D289 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trappc6bQ9D289 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trappc6bQ9D289 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trappc6bQ9D289 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Trappc6bQ9D289 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trappc6bQ9D289 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trappc6bQ9D289 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trappc6bQ9D289 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Trappc6bQ9D289 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trappc6bQ9D289 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trappc6bQ9D289 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trappc6bQ9D289 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trappc6bQ9D289 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Trappc6bQ9D289 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trappc6bQ9D289 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trappc6bQ9D289 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trappc6bQ9D289 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc6bQ9D289 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc6bQ9D289 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc6bQ9D289 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc6bQ9D289 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc6bQ9D289 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trappc6bQ9D289 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trappc6bQ9D289 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trappc6bQ9D289 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Trappc6bQ9D289 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trappc6bQ9D289 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trappc6bQ9D289 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trappc6bQ9D289 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc6bQ9D289 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Trappc6bQ9D289 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trappc6bQ9D289 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trappc6bQ9D289 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc6bQ9D289 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc6bQ9D289 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trappc6bQ9D289 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Trappc6bQ9D289 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trappc6bQ9D289 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Trappc6bQ9D289 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trappc6bQ9D289 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trappc6bQ9D289 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trappc6bQ9D289 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trappc6bQ9D289 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trappc6bQ9D289 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc6bQ9D289 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc6bQ9D289 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc6bQ9D289 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Trappc6bQ9D289 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc6bQ9D289 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc6bQ9D289 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc6bQ9D289 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trappc6bQ9D289 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc6bQ9D289 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trappc6bQ9D289 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trappc6bQ9D289 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Trappc6bQ9D289 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trappc6bQ9D289 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trappc6bQ9D289 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trappc6bQ9D289 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc6bQ9D289 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc6bQ9D289 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc6bQ9D289 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trappc6bQ9D289 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trappc6bQ9D289 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trappc6bQ9D289 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trappc6bQ9D289 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trappc6bQ9D289 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms