Protein–RNA interactions for Protein: Q9D174

Ss18l2, SS18-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18l2Q9D174 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ss18l2Q9D174 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ss18l2Q9D174 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ss18l2Q9D174 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ss18l2Q9D174 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ss18l2Q9D174 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ss18l2Q9D174 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ss18l2Q9D174 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ss18l2Q9D174 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ss18l2Q9D174 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ss18l2Q9D174 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ss18l2Q9D174 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ss18l2Q9D174 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ss18l2Q9D174 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Ss18l2Q9D174 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ss18l2Q9D174 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ss18l2Q9D174 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ss18l2Q9D174 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ss18l2Q9D174 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ss18l2Q9D174 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ss18l2Q9D174 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ss18l2Q9D174 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ss18l2Q9D174 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ss18l2Q9D174 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ss18l2Q9D174 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ss18l2Q9D174 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ss18l2Q9D174 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ss18l2Q9D174 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ss18l2Q9D174 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ss18l2Q9D174 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ss18l2Q9D174 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ss18l2Q9D174 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ss18l2Q9D174 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ss18l2Q9D174 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ss18l2Q9D174 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ss18l2Q9D174 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ss18l2Q9D174 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ss18l2Q9D174 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ss18l2Q9D174 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ss18l2Q9D174 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ss18l2Q9D174 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ss18l2Q9D174 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ss18l2Q9D174 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ss18l2Q9D174 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ss18l2Q9D174 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ss18l2Q9D174 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ss18l2Q9D174 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ss18l2Q9D174 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ss18l2Q9D174 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ss18l2Q9D174 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ss18l2Q9D174 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ss18l2Q9D174 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ss18l2Q9D174 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ss18l2Q9D174 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ss18l2Q9D174 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ss18l2Q9D174 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ss18l2Q9D174 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ss18l2Q9D174 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ss18l2Q9D174 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ss18l2Q9D174 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ss18l2Q9D174 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ss18l2Q9D174 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ss18l2Q9D174 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ss18l2Q9D174 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ss18l2Q9D174 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ss18l2Q9D174 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ss18l2Q9D174 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ss18l2Q9D174 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ss18l2Q9D174 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ss18l2Q9D174 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ss18l2Q9D174 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ss18l2Q9D174 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ss18l2Q9D174 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ss18l2Q9D174 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ss18l2Q9D174 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ss18l2Q9D174 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ss18l2Q9D174 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ss18l2Q9D174 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ss18l2Q9D174 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ss18l2Q9D174 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ss18l2Q9D174 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ss18l2Q9D174 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ss18l2Q9D174 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ss18l2Q9D174 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ss18l2Q9D174 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ss18l2Q9D174 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ss18l2Q9D174 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ss18l2Q9D174 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ss18l2Q9D174 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ss18l2Q9D174 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ss18l2Q9D174 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ss18l2Q9D174 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ss18l2Q9D174 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ss18l2Q9D174 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ss18l2Q9D174 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ss18l2Q9D174 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ss18l2Q9D174 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ss18l2Q9D174 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ss18l2Q9D174 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ss18l2Q9D174 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms