Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0C4

Trmt5, tRNA (guanine(37)-N1)-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt5Q9D0C4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trmt5Q9D0C4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trmt5Q9D0C4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trmt5Q9D0C4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trmt5Q9D0C4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trmt5Q9D0C4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trmt5Q9D0C4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trmt5Q9D0C4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trmt5Q9D0C4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trmt5Q9D0C4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trmt5Q9D0C4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trmt5Q9D0C4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trmt5Q9D0C4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trmt5Q9D0C4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trmt5Q9D0C4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trmt5Q9D0C4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trmt5Q9D0C4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trmt5Q9D0C4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trmt5Q9D0C4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trmt5Q9D0C4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trmt5Q9D0C4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trmt5Q9D0C4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trmt5Q9D0C4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trmt5Q9D0C4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Trmt5Q9D0C4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trmt5Q9D0C4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trmt5Q9D0C4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trmt5Q9D0C4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Trmt5Q9D0C4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trmt5Q9D0C4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trmt5Q9D0C4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trmt5Q9D0C4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trmt5Q9D0C4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trmt5Q9D0C4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trmt5Q9D0C4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trmt5Q9D0C4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trmt5Q9D0C4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trmt5Q9D0C4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trmt5Q9D0C4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trmt5Q9D0C4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trmt5Q9D0C4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trmt5Q9D0C4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trmt5Q9D0C4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Trmt5Q9D0C4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trmt5Q9D0C4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trmt5Q9D0C4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Trmt5Q9D0C4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Trmt5Q9D0C4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trmt5Q9D0C4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trmt5Q9D0C4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trmt5Q9D0C4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trmt5Q9D0C4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trmt5Q9D0C4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trmt5Q9D0C4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Trmt5Q9D0C4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trmt5Q9D0C4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Trmt5Q9D0C4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trmt5Q9D0C4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trmt5Q9D0C4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trmt5Q9D0C4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trmt5Q9D0C4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trmt5Q9D0C4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trmt5Q9D0C4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trmt5Q9D0C4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trmt5Q9D0C4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trmt5Q9D0C4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trmt5Q9D0C4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trmt5Q9D0C4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Trmt5Q9D0C4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trmt5Q9D0C4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trmt5Q9D0C4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trmt5Q9D0C4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trmt5Q9D0C4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trmt5Q9D0C4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trmt5Q9D0C4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trmt5Q9D0C4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trmt5Q9D0C4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Trmt5Q9D0C4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trmt5Q9D0C4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trmt5Q9D0C4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trmt5Q9D0C4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trmt5Q9D0C4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trmt5Q9D0C4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trmt5Q9D0C4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trmt5Q9D0C4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trmt5Q9D0C4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trmt5Q9D0C4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trmt5Q9D0C4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trmt5Q9D0C4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trmt5Q9D0C4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trmt5Q9D0C4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trmt5Q9D0C4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trmt5Q9D0C4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trmt5Q9D0C4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trmt5Q9D0C4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Trmt5Q9D0C4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trmt5Q9D0C4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trmt5Q9D0C4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trmt5Q9D0C4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trmt5Q9D0C4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms