Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZV8

Fbxl20, F-box/LRR-repeat protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxl20Q9CZV8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Fbxl20Q9CZV8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fbxl20Q9CZV8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fbxl20Q9CZV8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fbxl20Q9CZV8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fbxl20Q9CZV8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fbxl20Q9CZV8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fbxl20Q9CZV8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fbxl20Q9CZV8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fbxl20Q9CZV8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fbxl20Q9CZV8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fbxl20Q9CZV8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fbxl20Q9CZV8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fbxl20Q9CZV8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Fbxl20Q9CZV8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Fbxl20Q9CZV8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fbxl20Q9CZV8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fbxl20Q9CZV8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fbxl20Q9CZV8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fbxl20Q9CZV8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fbxl20Q9CZV8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fbxl20Q9CZV8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fbxl20Q9CZV8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fbxl20Q9CZV8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fbxl20Q9CZV8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fbxl20Q9CZV8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fbxl20Q9CZV8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Fbxl20Q9CZV8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fbxl20Q9CZV8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fbxl20Q9CZV8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Fbxl20Q9CZV8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fbxl20Q9CZV8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fbxl20Q9CZV8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fbxl20Q9CZV8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fbxl20Q9CZV8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Fbxl20Q9CZV8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fbxl20Q9CZV8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fbxl20Q9CZV8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fbxl20Q9CZV8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fbxl20Q9CZV8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fbxl20Q9CZV8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fbxl20Q9CZV8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Fbxl20Q9CZV8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fbxl20Q9CZV8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fbxl20Q9CZV8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fbxl20Q9CZV8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fbxl20Q9CZV8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fbxl20Q9CZV8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fbxl20Q9CZV8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fbxl20Q9CZV8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fbxl20Q9CZV8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fbxl20Q9CZV8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fbxl20Q9CZV8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fbxl20Q9CZV8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fbxl20Q9CZV8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fbxl20Q9CZV8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fbxl20Q9CZV8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fbxl20Q9CZV8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fbxl20Q9CZV8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Fbxl20Q9CZV8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fbxl20Q9CZV8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fbxl20Q9CZV8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fbxl20Q9CZV8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fbxl20Q9CZV8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fbxl20Q9CZV8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fbxl20Q9CZV8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fbxl20Q9CZV8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fbxl20Q9CZV8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fbxl20Q9CZV8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fbxl20Q9CZV8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fbxl20Q9CZV8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fbxl20Q9CZV8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fbxl20Q9CZV8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fbxl20Q9CZV8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fbxl20Q9CZV8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fbxl20Q9CZV8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fbxl20Q9CZV8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fbxl20Q9CZV8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fbxl20Q9CZV8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fbxl20Q9CZV8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fbxl20Q9CZV8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fbxl20Q9CZV8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fbxl20Q9CZV8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fbxl20Q9CZV8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fbxl20Q9CZV8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fbxl20Q9CZV8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fbxl20Q9CZV8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fbxl20Q9CZV8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fbxl20Q9CZV8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fbxl20Q9CZV8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fbxl20Q9CZV8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fbxl20Q9CZV8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fbxl20Q9CZV8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fbxl20Q9CZV8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fbxl20Q9CZV8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fbxl20Q9CZV8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fbxl20Q9CZV8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fbxl20Q9CZV8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fbxl20Q9CZV8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Fbxl20Q9CZV8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms