Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYZ8

Ssbp2, Single-stranded DNA-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp2Q9CYZ8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20,92■□□□□ 0,94
Ssbp2Q9CYZ8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
Ssbp2Q9CYZ8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,9■□□□□ 0,94
Ssbp2Q9CYZ8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20,89■□□□□ 0,93
Ssbp2Q9CYZ8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,88■□□□□ 0,93
Ssbp2Q9CYZ8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20,88■□□□□ 0,93
Ssbp2Q9CYZ8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20,86■□□□□ 0,93
Ssbp2Q9CYZ8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
Ssbp2Q9CYZ8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20,84■□□□□ 0,93
Ssbp2Q9CYZ8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,83■□□□□ 0,93
Ssbp2Q9CYZ8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,83■□□□□ 0,92
Ssbp2Q9CYZ8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20,82■□□□□ 0,92
Ssbp2Q9CYZ8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,81■□□□□ 0,92
Ssbp2Q9CYZ8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,81■□□□□ 0,92
Ssbp2Q9CYZ8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC20,8■□□□□ 0,92
Ssbp2Q9CYZ8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Ssbp2Q9CYZ8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC20,77■□□□□ 0,92
Ssbp2Q9CYZ8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
Ssbp2Q9CYZ8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
Ssbp2Q9CYZ8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
Ssbp2Q9CYZ8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,75■□□□□ 0,91
Ssbp2Q9CYZ8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20,75■□□□□ 0,91
Ssbp2Q9CYZ8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,73■□□□□ 0,91
Ssbp2Q9CYZ8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20,68■□□□□ 0,9
Ssbp2Q9CYZ8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20,67■□□□□ 0,9
Ssbp2Q9CYZ8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,67■□□□□ 0,9
Ssbp2Q9CYZ8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,67■□□□□ 0,9
Ssbp2Q9CYZ8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,66■□□□□ 0,9
Ssbp2Q9CYZ8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,66■□□□□ 0,9
Ssbp2Q9CYZ8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,65■□□□□ 0,9
Ssbp2Q9CYZ8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,65■□□□□ 0,9
Ssbp2Q9CYZ8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC20,65■□□□□ 0,9
Ssbp2Q9CYZ8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20,64■□□□□ 0,89
Ssbp2Q9CYZ8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,64■□□□□ 0,89
Ssbp2Q9CYZ8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,63■□□□□ 0,89
Ssbp2Q9CYZ8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,62■□□□□ 0,89
Ssbp2Q9CYZ8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,62■□□□□ 0,89
Ssbp2Q9CYZ8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,58■□□□□ 0,89
Ssbp2Q9CYZ8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,57■□□□□ 0,88
Ssbp2Q9CYZ8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20,56■□□□□ 0,88
Ssbp2Q9CYZ8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,56■□□□□ 0,88
Ssbp2Q9CYZ8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20,56■□□□□ 0,88
Ssbp2Q9CYZ8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,55■□□□□ 0,88
Ssbp2Q9CYZ8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20,55■□□□□ 0,88
Ssbp2Q9CYZ8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,55■□□□□ 0,88
Ssbp2Q9CYZ8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,54■□□□□ 0,88
Ssbp2Q9CYZ8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,53■□□□□ 0,88
Ssbp2Q9CYZ8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,52■□□□□ 0,88
Ssbp2Q9CYZ8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,52■□□□□ 0,87
Ssbp2Q9CYZ8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,52■□□□□ 0,87
Ssbp2Q9CYZ8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,52■□□□□ 0,87
Ssbp2Q9CYZ8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
Ssbp2Q9CYZ8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,5■□□□□ 0,87
Ssbp2Q9CYZ8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20,5■□□□□ 0,87
Ssbp2Q9CYZ8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20,5■□□□□ 0,87
Ssbp2Q9CYZ8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20,5■□□□□ 0,87
Ssbp2Q9CYZ8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,49■□□□□ 0,87
Ssbp2Q9CYZ8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20,49■□□□□ 0,87
Ssbp2Q9CYZ8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20,49■□□□□ 0,87
Ssbp2Q9CYZ8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20,47■□□□□ 0,87
Ssbp2Q9CYZ8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20,47■□□□□ 0,87
Ssbp2Q9CYZ8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20,47■□□□□ 0,87
Ssbp2Q9CYZ8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,47■□□□□ 0,87
Ssbp2Q9CYZ8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,46■□□□□ 0,87
Ssbp2Q9CYZ8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,45■□□□□ 0,86
Ssbp2Q9CYZ8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20,45■□□□□ 0,86
Ssbp2Q9CYZ8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,44■□□□□ 0,86
Ssbp2Q9CYZ8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20,43■□□□□ 0,86
Ssbp2Q9CYZ8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,43■□□□□ 0,86
Ssbp2Q9CYZ8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,42■□□□□ 0,86
Ssbp2Q9CYZ8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,41■□□□□ 0,86
Ssbp2Q9CYZ8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20,41■□□□□ 0,86
Ssbp2Q9CYZ8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,41■□□□□ 0,86
Ssbp2Q9CYZ8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20,41■□□□□ 0,86
Ssbp2Q9CYZ8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20,38■□□□□ 0,85
Ssbp2Q9CYZ8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,37■□□□□ 0,85
Ssbp2Q9CYZ8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,36■□□□□ 0,85
Ssbp2Q9CYZ8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,36■□□□□ 0,85
Ssbp2Q9CYZ8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20,35■□□□□ 0,85
Ssbp2Q9CYZ8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,35■□□□□ 0,85
Ssbp2Q9CYZ8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20,35■□□□□ 0,85
Ssbp2Q9CYZ8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,34■□□□□ 0,85
Ssbp2Q9CYZ8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,32■□□□□ 0,84
Ssbp2Q9CYZ8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20,32■□□□□ 0,84
Ssbp2Q9CYZ8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,32■□□□□ 0,84
Ssbp2Q9CYZ8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,31■□□□□ 0,84
Ssbp2Q9CYZ8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20,31■□□□□ 0,84
Ssbp2Q9CYZ8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20,3■□□□□ 0,84
Ssbp2Q9CYZ8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,3■□□□□ 0,84
Ssbp2Q9CYZ8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,29■□□□□ 0,84
Ssbp2Q9CYZ8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20,28■□□□□ 0,84
Ssbp2Q9CYZ8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,28■□□□□ 0,84
Ssbp2Q9CYZ8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,27■□□□□ 0,84
Ssbp2Q9CYZ8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20,26■□□□□ 0,83
Ssbp2Q9CYZ8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,26■□□□□ 0,83
Ssbp2Q9CYZ8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,26■□□□□ 0,83
Ssbp2Q9CYZ8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,25■□□□□ 0,83
Ssbp2Q9CYZ8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20,24■□□□□ 0,83
Ssbp2Q9CYZ8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20,23■□□□□ 0,83
Ssbp2Q9CYZ8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20,23■□□□□ 0,83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,2 ms