Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYD3

Crtap, Cartilage-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrtapQ9CYD3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CrtapQ9CYD3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CrtapQ9CYD3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CrtapQ9CYD3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CrtapQ9CYD3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CrtapQ9CYD3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CrtapQ9CYD3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CrtapQ9CYD3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CrtapQ9CYD3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CrtapQ9CYD3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CrtapQ9CYD3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CrtapQ9CYD3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CrtapQ9CYD3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CrtapQ9CYD3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CrtapQ9CYD3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CrtapQ9CYD3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CrtapQ9CYD3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CrtapQ9CYD3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CrtapQ9CYD3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CrtapQ9CYD3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CrtapQ9CYD3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CrtapQ9CYD3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CrtapQ9CYD3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CrtapQ9CYD3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CrtapQ9CYD3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CrtapQ9CYD3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CrtapQ9CYD3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CrtapQ9CYD3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CrtapQ9CYD3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CrtapQ9CYD3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CrtapQ9CYD3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CrtapQ9CYD3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CrtapQ9CYD3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CrtapQ9CYD3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CrtapQ9CYD3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CrtapQ9CYD3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CrtapQ9CYD3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CrtapQ9CYD3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CrtapQ9CYD3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CrtapQ9CYD3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CrtapQ9CYD3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CrtapQ9CYD3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CrtapQ9CYD3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CrtapQ9CYD3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CrtapQ9CYD3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CrtapQ9CYD3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CrtapQ9CYD3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CrtapQ9CYD3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CrtapQ9CYD3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CrtapQ9CYD3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CrtapQ9CYD3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CrtapQ9CYD3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CrtapQ9CYD3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CrtapQ9CYD3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CrtapQ9CYD3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CrtapQ9CYD3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CrtapQ9CYD3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CrtapQ9CYD3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CrtapQ9CYD3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CrtapQ9CYD3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CrtapQ9CYD3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CrtapQ9CYD3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CrtapQ9CYD3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CrtapQ9CYD3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CrtapQ9CYD3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CrtapQ9CYD3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CrtapQ9CYD3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CrtapQ9CYD3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CrtapQ9CYD3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CrtapQ9CYD3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CrtapQ9CYD3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CrtapQ9CYD3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CrtapQ9CYD3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CrtapQ9CYD3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CrtapQ9CYD3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CrtapQ9CYD3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CrtapQ9CYD3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CrtapQ9CYD3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CrtapQ9CYD3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CrtapQ9CYD3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CrtapQ9CYD3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CrtapQ9CYD3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CrtapQ9CYD3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CrtapQ9CYD3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CrtapQ9CYD3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CrtapQ9CYD3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CrtapQ9CYD3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CrtapQ9CYD3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CrtapQ9CYD3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CrtapQ9CYD3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CrtapQ9CYD3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CrtapQ9CYD3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CrtapQ9CYD3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CrtapQ9CYD3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CrtapQ9CYD3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CrtapQ9CYD3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CrtapQ9CYD3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CrtapQ9CYD3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CrtapQ9CYD3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CrtapQ9CYD3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms