Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl11Q9CXW4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rpl11Q9CXW4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Rpl11Q9CXW4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rpl11Q9CXW4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpl11Q9CXW4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpl11Q9CXW4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpl11Q9CXW4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpl11Q9CXW4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rpl11Q9CXW4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rpl11Q9CXW4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rpl11Q9CXW4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Rpl11Q9CXW4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rpl11Q9CXW4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rpl11Q9CXW4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rpl11Q9CXW4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rpl11Q9CXW4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpl11Q9CXW4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpl11Q9CXW4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rpl11Q9CXW4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rpl11Q9CXW4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rpl11Q9CXW4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rpl11Q9CXW4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpl11Q9CXW4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpl11Q9CXW4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpl11Q9CXW4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rpl11Q9CXW4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rpl11Q9CXW4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rpl11Q9CXW4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rpl11Q9CXW4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rpl11Q9CXW4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Rpl11Q9CXW4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rpl11Q9CXW4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rpl11Q9CXW4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rpl11Q9CXW4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rpl11Q9CXW4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Rpl11Q9CXW4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rpl11Q9CXW4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rpl11Q9CXW4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Rpl11Q9CXW4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rpl11Q9CXW4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rpl11Q9CXW4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rpl11Q9CXW4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rpl11Q9CXW4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rpl11Q9CXW4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rpl11Q9CXW4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rpl11Q9CXW4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rpl11Q9CXW4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rpl11Q9CXW4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rpl11Q9CXW4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rpl11Q9CXW4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rpl11Q9CXW4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rpl11Q9CXW4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Rpl11Q9CXW4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rpl11Q9CXW4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rpl11Q9CXW4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Rpl11Q9CXW4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rpl11Q9CXW4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rpl11Q9CXW4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rpl11Q9CXW4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rpl11Q9CXW4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rpl11Q9CXW4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rpl11Q9CXW4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rpl11Q9CXW4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rpl11Q9CXW4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rpl11Q9CXW4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rpl11Q9CXW4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rpl11Q9CXW4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rpl11Q9CXW4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rpl11Q9CXW4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rpl11Q9CXW4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rpl11Q9CXW4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rpl11Q9CXW4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rpl11Q9CXW4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rpl11Q9CXW4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rpl11Q9CXW4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rpl11Q9CXW4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rpl11Q9CXW4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rpl11Q9CXW4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rpl11Q9CXW4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rpl11Q9CXW4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rpl11Q9CXW4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rpl11Q9CXW4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rpl11Q9CXW4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rpl11Q9CXW4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rpl11Q9CXW4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rpl11Q9CXW4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rpl11Q9CXW4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rpl11Q9CXW4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rpl11Q9CXW4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rpl11Q9CXW4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rpl11Q9CXW4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rpl11Q9CXW4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rpl11Q9CXW4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rpl11Q9CXW4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rpl11Q9CXW4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rpl11Q9CXW4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rpl11Q9CXW4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rpl11Q9CXW4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rpl11Q9CXW4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms